Protein–RNA interactions for Protein: Q06053

DUS3, tRNA-dihydrouridine(47) synthase [NAD(P)(+)], yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS3Q06053 STB1YNL309W 1263 nt12.16□□□□□ -0.46
DUS3Q06053 SPC25YER018C 666 nt12.15□□□□□ -0.46
DUS3Q06053 YLR415CYLR415C 339 nt12.15□□□□□ -0.46
DUS3Q06053 ATF2YGR177C 1608 nt12.14□□□□□ -0.47
DUS3Q06053 CCT4YDL143W 1587 nt12.13□□□□□ -0.47
DUS3Q06053 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.12□□□□□ -0.47
DUS3Q06053 NAT4YMR069W 858 nt12.11□□□□□ -0.47
DUS3Q06053 BDF1YLR399C 2061 nt12.1□□□□□ -0.47
DUS3Q06053 GPI16YHR188C 1833 nt12.08□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 VPS60YDR486C 690 nt12.07□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 ERF2YLR246W 1080 nt12.07□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 DDR2YOL052C-A 186 nt12.07□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 YFL067WYFL067W 528 nt12.05□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 SEC11YIR022W 504 nt12.05□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 CRR1YLR213C 1269 nt12.05□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 SWC5YBR231C 912 nt12.04□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 GLK1YCL040W 1503 nt12.04□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 ALG3YBL082C 1377 nt12.04□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 MIR1YJR077C 936 nt12.03□□□□□ -0.48
DUS3Q06053 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.02□□□□□ -0.49
DUS3Q06053 MSF1YPR047W 1410 nt12.01□□□□□ -0.49
DUS3Q06053 FEN2YCR028C 1539 nt11.99□□□□□ -0.49
DUS3Q06053 ANP1YEL036C 1503 nt11.99□□□□□ -0.49
DUS3Q06053 NCP1YHR042W 2076 nt11.99□□□□□ -0.49
DUS3Q06053 THI74YDR438W 1113 nt11.98□□□□□ -0.49
DUS3Q06053 VPS75YNL246W 795 nt11.98□□□□□ -0.49
DUS3Q06053 TAT1YBR069C 1860 nt11.95□□□□□ -0.5
DUS3Q06053 SPT8YLR055C 1809 nt11.95□□□□□ -0.5
DUS3Q06053 PCH2YBR186W 1695 nt11.94□□□□□ -0.5
DUS3Q06053 SNG1YGR197C 1644 nt11.94□□□□□ -0.5
DUS3Q06053 LYS4YDR234W 2082 nt11.93□□□□□ -0.5
DUS3Q06053 MIC10YCL057C-A 294 nt11.93□□□□□ -0.5
DUS3Q06053 HEM12YDR047W 1089 nt11.9□□□□□ -0.5
DUS3Q06053 PAC11YDR488C 1602 nt11.87□□□□□ -0.51
DUS3Q06053 YIR016WYIR016W 798 nt11.87□□□□□ -0.51
DUS3Q06053 GUT2YIL155C 1950 nt11.87□□□□□ -0.51
DUS3Q06053 DAT1YML113W 747 nt11.85□□□□□ -0.51
DUS3Q06053 YMR244WYMR244W 1068 nt11.81□□□□□ -0.52
DUS3Q06053 TIM17YJL143W 477 nt11.79□□□□□ -0.52
DUS3Q06053 PAU7YAR020C 168 nt11.79□□□□□ -0.52
DUS3Q06053 BOP3YNL042W 1191 nt11.77□□□□□ -0.53
DUS3Q06053 PIB2YGL023C 1908 nt11.76□□□□□ -0.53
DUS3Q06053 UBA4YHR111W 1323 nt11.76□□□□□ -0.53
DUS3Q06053 RTF1YGL244W 1677 nt11.75□□□□□ -0.53
DUS3Q06053 NVJ2YPR091C 2313 nt11.75□□□□□ -0.53
DUS3Q06053 YGL034CYGL034C 366 nt11.75□□□□□ -0.53
DUS3Q06053 SHB17YKR043C 816 nt11.75□□□□□ -0.53
DUS3Q06053 SHM2YLR058C 1410 nt11.75□□□□□ -0.53
DUS3Q06053 GLR1YPL091W 1452 nt11.7□□□□□ -0.54
DUS3Q06053 XDJ1YLR090W 1380 nt11.7□□□□□ -0.54
DUS3Q06053 YDR010CYDR010C 333 nt11.68□□□□□ -0.54
DUS3Q06053 YSR3YKR053C 1215 nt11.68□□□□□ -0.54
DUS3Q06053 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.67□□□□□ -0.54
DUS3Q06053 NIT1YIL164C 600 nt11.67□□□□□ -0.54
DUS3Q06053 SGT2YOR007C 1041 nt11.66□□□□□ -0.54
DUS3Q06053 MIC12YBR262C 321 nt11.66□□□□□ -0.54
DUS3Q06053 XYL2YLR070C 1071 nt11.64□□□□□ -0.55
DUS3Q06053 BNA2YJR078W 1362 nt11.63□□□□□ -0.55
DUS3Q06053 NDI1YML120C 1542 nt11.61□□□□□ -0.55
DUS3Q06053 PTK1YKL198C 1989 nt11.6□□□□□ -0.55
DUS3Q06053 GDH3YAL062W 1374 nt11.6□□□□□ -0.55
DUS3Q06053 RBG1YAL036C 1110 nt11.6□□□□□ -0.55
DUS3Q06053 RBG2YGR173W 1107 nt11.57□□□□□ -0.56
DUS3Q06053 RET2YFR051C 1641 nt11.57□□□□□ -0.56
DUS3Q06053 RAX1YOR301W 1308 nt11.56□□□□□ -0.56
DUS3Q06053 PHO89YBR296C 1725 nt11.55□□□□□ -0.56
DUS3Q06053 YGR201CYGR201C 678 nt11.52□□□□□ -0.57
DUS3Q06053 HHO1YPL127C 777 nt11.51□□□□□ -0.57
DUS3Q06053 YCR087WYCR087W 516 nt11.5□□□□□ -0.57
DUS3Q06053 AIM45YPR004C 1035 nt11.5□□□□□ -0.57
DUS3Q06053 AVT6YER119C 1347 nt11.45□□□□□ -0.58
DUS3Q06053 COQ2YNR041C 1119 nt11.42□□□□□ -0.58
DUS3Q06053 YFL054CYFL054C 1941 nt11.41□□□□□ -0.58
DUS3Q06053 SFA1YDL168W 1161 nt11.39□□□□□ -0.59
DUS3Q06053 AGP1YCL025C 1902 nt11.39□□□□□ -0.59
DUS3Q06053 MRP20YDR405W 792 nt11.38□□□□□ -0.59
DUS3Q06053 DUT1YBR252W 444 nt11.38□□□□□ -0.59
DUS3Q06053 YMR226CYMR226C 804 nt11.37□□□□□ -0.59
DUS3Q06053 GOR1YNL274C 1053 nt11.36□□□□□ -0.59
DUS3Q06053 YCR102CYCR102C 1107 nt11.33□□□□□ -0.6
DUS3Q06053 CCA1YER168C 1641 nt11.32□□□□□ -0.6
DUS3Q06053 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.3□□□□□ -0.6
DUS3Q06053 SAM1YLR180W 1149 nt11.28□□□□□ -0.6
DUS3Q06053 SHH4YLR164W 507 nt11.25□□□□□ -0.61
DUS3Q06053 RPL4BYDR012W 1089 nt11.24□□□□□ -0.61
DUS3Q06053 YLR111WYLR111W 333 nt11.24□□□□□ -0.61
DUS3Q06053 RPL4AYBR031W 1089 nt11.24□□□□□ -0.61
DUS3Q06053 NBP35YGL091C 987 nt11.21□□□□□ -0.61
DUS3Q06053 RPS14BYJL191W 417 nt11.21□□□□□ -0.61
DUS3Q06053 SWE1YJL187C 2460 nt11.2□□□□□ -0.62
DUS3Q06053 TIR3YIL011W 810 nt11.18□□□□□ -0.62
DUS3Q06053 SDH5YOL071W 489 nt11.17□□□□□ -0.62
DUS3Q06053 NME1NME1 340 nt11.16□□□□□ -0.62
DUS3Q06053 CAB5YDR196C 726 nt11.15□□□□□ -0.62
DUS3Q06053 CLB6YGR109C 1143 nt11.15□□□□□ -0.62
DUS3Q06053 TOM6YOR045W 186 nt11.15□□□□□ -0.62
DUS3Q06053 RAD51YER095W 1203 nt11.14□□□□□ -0.63
DUS3Q06053 UTH1YKR042W 1098 nt11.12□□□□□ -0.63
DUS3Q06053 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.12□□□□□ -0.63
DUS3Q06053 RAD23YEL037C 1197 nt11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms