Protein–RNA interactions for Protein: Q04835

YMR253C, Uncharacterized membrane protein YMR253C, yeastyeast

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR253CQ04835 YLR281CYLR281C 468 nt8.91□□□□□ -0.98
YMR253CQ04835 YAT1YAR035W 2064 nt8.91□□□□□ -0.98
YMR253CQ04835 AGP1YCL025C 1902 nt8.91□□□□□ -0.98
YMR253CQ04835 DUS1YML080W 1272 nt8.89□□□□□ -0.99
YMR253CQ04835 RNQ1YCL028W 1218 nt8.89□□□□□ -0.99
YMR253CQ04835 FTR1YER145C 1215 nt8.85□□□□□ -0.99
YMR253CQ04835 TRM5YHR070W 1500 nt8.85□□□□□ -0.99
YMR253CQ04835 DDR2YOL052C-A 186 nt8.83□□□□□ -1
YMR253CQ04835 YCL042WYCL042W 360 nt8.83□□□□□ -1
YMR253CQ04835 BNA2YJR078W 1362 nt8.83□□□□□ -1
YMR253CQ04835 NDI1YML120C 1542 nt8.82□□□□□ -1
YMR253CQ04835 GAL1YBR020W 1587 nt8.82□□□□□ -1
YMR253CQ04835 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.81□□□□□ -1
YMR253CQ04835 MIC12YBR262C 321 nt8.81□□□□□ -1
YMR253CQ04835 MXR2YCL033C 507 nt8.81□□□□□ -1
YMR253CQ04835 IMP2'YIL154C 1041 nt8.8□□□□□ -1
YMR253CQ04835 ANP1YEL036C 1503 nt8.79□□□□□ -1
YMR253CQ04835 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.76□□□□□ -1.01
YMR253CQ04835 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.76□□□□□ -1.01
YMR253CQ04835 YDR433WYDR433W 441 nt8.76□□□□□ -1.01
YMR253CQ04835 PUS2YGL063W 1113 nt8.76□□□□□ -1.01
YMR253CQ04835 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.75□□□□□ -1.01
YMR253CQ04835 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.75□□□□□ -1.01
YMR253CQ04835 HHO1YPL127C 777 nt8.72□□□□□ -1.01
YMR253CQ04835 FRD1YEL047C 1413 nt8.71□□□□□ -1.01
YMR253CQ04835 SPT20YOL148C 1815 nt8.71□□□□□ -1.01
YMR253CQ04835 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.71□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.71□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.71□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.71□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.71□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 Q0182Q0182 405 nt8.71□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 HEL2YDR266C 1920 nt8.7□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 FMP45YDL222C 930 nt8.7□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 DIC1YLR348C 897 nt8.7□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 STR3YGL184C 1398 nt8.7□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 XDJ1YLR090W 1380 nt8.69□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 SSN3YPL042C 1668 nt8.68□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 MET2YNL277W 1461 nt8.67□□□□□ -1.02
YMR253CQ04835 FEN2YCR028C 1539 nt8.64□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 RPC82YPR190C 1965 nt8.64□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.64□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 DUT1YBR252W 444 nt8.64□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 STB1YNL309W 1263 nt8.62□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 AQY1YPR192W 918 nt8.62□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 SPC25YER018C 666 nt8.6□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 AQY2YLL052C 450 nt8.6□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 INA1YLR413W 2028 nt8.59□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 YGR201CYGR201C 678 nt8.59□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 YIR016WYIR016W 798 nt8.59□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 YPR011CYPR011C 981 nt8.59□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 GDH3YAL062W 1374 nt8.59□□□□□ -1.03
YMR253CQ04835 RIM8YGL045W 1629 nt8.58□□□□□ -1.04
YMR253CQ04835 RTN2YDL204W 1182 nt8.58□□□□□ -1.04
YMR253CQ04835 YKR040CYKR040C 504 nt8.58□□□□□ -1.04
YMR253CQ04835 GID7YCL039W 2238 nt8.57□□□□□ -1.04
YMR253CQ04835 ERV46YAL042W 1248 nt8.56□□□□□ -1.04
YMR253CQ04835 GPI16YHR188C 1833 nt8.56□□□□□ -1.04
YMR253CQ04835 LPX1YOR084W 1164 nt8.55□□□□□ -1.04
YMR253CQ04835 VPS60YDR486C 690 nt8.53□□□□□ -1.04
YMR253CQ04835 YGL114WYGL114W 2178 nt8.5□□□□□ -1.05
YMR253CQ04835 HIF1YLL022C 1158 nt8.5□□□□□ -1.05
YMR253CQ04835 SFP1YLR403W 2052 nt8.5□□□□□ -1.05
YMR253CQ04835 ALG3YBL082C 1377 nt8.49□□□□□ -1.05
YMR253CQ04835 MUP1YGR055W 1725 nt8.49□□□□□ -1.05
YMR253CQ04835 AVT6YER119C 1347 nt8.47□□□□□ -1.05
YMR253CQ04835 CCT4YDL143W 1587 nt8.47□□□□□ -1.05
YMR253CQ04835 GOR1YNL274C 1053 nt8.46□□□□□ -1.06
YMR253CQ04835 NPP1YCR026C 2229 nt8.46□□□□□ -1.06
YMR253CQ04835 ALD4YOR374W 1560 nt8.44□□□□□ -1.06
YMR253CQ04835 PRM5YIL117C 957 nt8.42□□□□□ -1.06
YMR253CQ04835 YLR179CYLR179C 606 nt8.42□□□□□ -1.06
YMR253CQ04835 TIM23YNR017W 669 nt8.42□□□□□ -1.06
YMR253CQ04835 SWC5YBR231C 912 nt8.42□□□□□ -1.06
YMR253CQ04835 MAE1YKL029C 2010 nt8.41□□□□□ -1.06
YMR253CQ04835 PLB1YMR008C 1995 nt8.41□□□□□ -1.06
YMR253CQ04835 HOL1YNR055C 1761 nt8.4□□□□□ -1.07
YMR253CQ04835 PTH1YHR189W 573 nt8.39□□□□□ -1.07
YMR253CQ04835 AHT1YHR093W 549 nt8.36□□□□□ -1.07
YMR253CQ04835 FRE6YLL051C 2139 nt8.33□□□□□ -1.08
YMR253CQ04835 YLR235CYLR235C 399 nt8.31□□□□□ -1.08
YMR253CQ04835 ARP6YLR085C 1317 nt8.3□□□□□ -1.08
YMR253CQ04835 ZRT3YKL175W 1512 nt8.3□□□□□ -1.08
YMR253CQ04835 MOT3YMR070W 1473 nt8.27□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 ACO2YJL200C 2370 nt8.27□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 UBX6YJL048C 1191 nt8.26□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 YJL067WYJL067W 351 nt8.26□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 ESBP6YNL125C 2022 nt8.25□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 NBP35YGL091C 987 nt8.25□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 SPP1YPL138C 1062 nt8.25□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 UTR1YJR049C 1593 nt8.25□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 YNL024CYNL024C 741 nt8.24□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 YMR209CYMR209C 1374 nt8.23□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 SHM2YLR058C 1410 nt8.23□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 DAT1YML113W 747 nt8.22□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 BSP1YPR171W 1731 nt8.22□□□□□ -1.09
YMR253CQ04835 YPR064WYPR064W 420 nt8.21□□□□□ -1.1
YMR253CQ04835 ILV3YJR016C 1758 nt8.2□□□□□ -1.1
YMR253CQ04835 ILV2YMR108W 2064 nt8.2□□□□□ -1.1
YMR253CQ04835 YOR325WYOR325W 474 nt8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms