Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 ADO1YJR105W 1023 nt8.86□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 YLR464WYLR464W 651 nt8.86□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 PTH1YHR189W 573 nt8.84□□□□□ -0.99
YHP1Q04116 HSP60YLR259C 1719 nt8.83□□□□□ -1
YHP1Q04116 YLR235CYLR235C 399 nt8.83□□□□□ -1
YHP1Q04116 RAX1YOR301W 1308 nt8.82□□□□□ -1
YHP1Q04116 CCA1YER168C 1641 nt8.82□□□□□ -1
YHP1Q04116 AQY1YPR192W 918 nt8.81□□□□□ -1
YHP1Q04116 ANP1YEL036C 1503 nt8.8□□□□□ -1
YHP1Q04116 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.8□□□□□ -1
YHP1Q04116 DDR2YOL052C-A 186 nt8.8□□□□□ -1
YHP1Q04116 YKL030WYKL030W 606 nt8.77□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 FUR4YBR021W 1902 nt8.77□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 HUA1YGR268C 597 nt8.76□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 TIM23YNR017W 669 nt8.76□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 SPC25YER018C 666 nt8.75□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 GLK1YCL040W 1503 nt8.75□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 STB1YNL309W 1263 nt8.74□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 MIC12YBR262C 321 nt8.74□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.73□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 WSC2YNL283C 1512 nt8.71□□□□□ -1.01
YHP1Q04116 YLR179CYLR179C 606 nt8.71□□□□□ -1.02
YHP1Q04116 FEN2YCR028C 1539 nt8.7□□□□□ -1.02
YHP1Q04116 AHT1YHR093W 549 nt8.69□□□□□ -1.02
YHP1Q04116 GPI16YHR188C 1833 nt8.68□□□□□ -1.02
YHP1Q04116 AGP1YCL025C 1902 nt8.68□□□□□ -1.02
YHP1Q04116 BNA2YJR078W 1362 nt8.67□□□□□ -1.02
YHP1Q04116 VPS60YDR486C 690 nt8.65□□□□□ -1.02
YHP1Q04116 CCT4YDL143W 1587 nt8.64□□□□□ -1.03
YHP1Q04116 ALG3YBL082C 1377 nt8.63□□□□□ -1.03
YHP1Q04116 YIR016WYIR016W 798 nt8.63□□□□□ -1.03
YHP1Q04116 UME6YDR207C 2511 nt8.62□□□□□ -1.03
YHP1Q04116 ALG12YNR030W 1656 nt8.61□□□□□ -1.03
YHP1Q04116 PRP4YPR178W 1398 nt8.61□□□□□ -1.03
YHP1Q04116 YPR064WYPR064W 420 nt8.6□□□□□ -1.03
YHP1Q04116 XDJ1YLR090W 1380 nt8.58□□□□□ -1.04
YHP1Q04116 HHO1YPL127C 777 nt8.57□□□□□ -1.04
YHP1Q04116 YGR201CYGR201C 678 nt8.56□□□□□ -1.04
YHP1Q04116 SWC5YBR231C 912 nt8.56□□□□□ -1.04
YHP1Q04116 DPS1YLL018C 1674 nt8.56□□□□□ -1.04
YHP1Q04116 YCL074WYCL074W 927 nt8.55□□□□□ -1.04
YHP1Q04116 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.55□□□□□ -1.04
YHP1Q04116 YKR005CYKR005C 1578 nt8.54□□□□□ -1.04
YHP1Q04116 TAD3YLR316C 969 nt8.54□□□□□ -1.04
YHP1Q04116 YDR094WYDR094W 336 nt8.52□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 UBX6YJL048C 1191 nt8.52□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 AAC1YMR056C 930 nt8.52□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 DUS1YML080W 1272 nt8.51□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 MCH5YOR306C 1566 nt8.49□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 BDH1YAL060W 1149 nt8.49□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 DUT1YBR252W 444 nt8.49□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.49□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.49□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 SNF1YDR477W 1902 nt8.48□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 BMT6YLR063W 1098 nt8.47□□□□□ -1.05
YHP1Q04116 YGR259CYGR259C 441 nt8.46□□□□□ -1.06
YHP1Q04116 STR3YGL184C 1398 nt8.45□□□□□ -1.06
YHP1Q04116 BIO5YNR056C 1686 nt8.43□□□□□ -1.06
YHP1Q04116 AVT6YER119C 1347 nt8.41□□□□□ -1.06
YHP1Q04116 YLR415CYLR415C 339 nt8.41□□□□□ -1.06
YHP1Q04116 GDH3YAL062W 1374 nt8.4□□□□□ -1.06
YHP1Q04116 YFR018CYFR018C 1092 nt8.4□□□□□ -1.06
YHP1Q04116 IRC24YIR036C 792 nt8.4□□□□□ -1.06
YHP1Q04116 YSP3YOR003W 1437 nt8.39□□□□□ -1.07
YHP1Q04116 SHM2YLR058C 1410 nt8.38□□□□□ -1.07
YHP1Q04116 GOR1YNL274C 1053 nt8.37□□□□□ -1.07
YHP1Q04116 NAR1YNL240C 1476 nt8.36□□□□□ -1.07
YHP1Q04116 PBP1YGR178C 2169 nt8.35□□□□□ -1.07
YHP1Q04116 RRT5YFR032C 870 nt8.35□□□□□ -1.07
YHP1Q04116 AQY2YLL052C 450 nt8.34□□□□□ -1.07
YHP1Q04116 DAT1YML113W 747 nt8.34□□□□□ -1.07
YHP1Q04116 PEX25YPL112C 1185 nt8.34□□□□□ -1.07
YHP1Q04116 RTN2YDL204W 1182 nt8.33□□□□□ -1.08
YHP1Q04116 NIT1YIL164C 600 nt8.33□□□□□ -1.08
YHP1Q04116 TIM17YJL143W 477 nt8.32□□□□□ -1.08
YHP1Q04116 PAU16YKL224C 372 nt8.3□□□□□ -1.08
YHP1Q04116 PRE6YOL038W 765 nt8.3□□□□□ -1.08
YHP1Q04116 YNL115CYNL115C 1935 nt8.3□□□□□ -1.08
YHP1Q04116 YFL066CYFL066C 1179 nt8.29□□□□□ -1.08
YHP1Q04116 CYT2YKL087C 675 nt8.29□□□□□ -1.08
YHP1Q04116 SGT2YOR007C 1041 nt8.26□□□□□ -1.09
YHP1Q04116 NBP35YGL091C 987 nt8.25□□□□□ -1.09
YHP1Q04116 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.24□□□□□ -1.09
YHP1Q04116 Q0182Q0182 405 nt8.22□□□□□ -1.09
YHP1Q04116 VPS75YNL246W 795 nt8.22□□□□□ -1.09
YHP1Q04116 ARP6YLR085C 1317 nt8.22□□□□□ -1.09
YHP1Q04116 YCR102CYCR102C 1107 nt8.21□□□□□ -1.1
YHP1Q04116 PLB1YMR008C 1995 nt8.2□□□□□ -1.1
YHP1Q04116 NAT4YMR069W 858 nt8.15□□□□□ -1.1
YHP1Q04116 PAU7YAR020C 168 nt8.14□□□□□ -1.11
YHP1Q04116 YAT1YAR035W 2064 nt8.11□□□□□ -1.11
YHP1Q04116 PRM5YIL117C 957 nt8.11□□□□□ -1.11
YHP1Q04116 TIR3YIL011W 810 nt8.1□□□□□ -1.11
YHP1Q04116 MIR1YJR077C 936 nt8.1□□□□□ -1.11
YHP1Q04116 SHH4YLR164W 507 nt8.1□□□□□ -1.11
YHP1Q04116 THI74YDR438W 1113 nt8.09□□□□□ -1.11
YHP1Q04116 LSC2YGR244C 1284 nt8.08□□□□□ -1.12
YHP1Q04116 HIF1YLL022C 1158 nt8.08□□□□□ -1.12
YHP1Q04116 UTR1YJR049C 1593 nt8.06□□□□□ -1.12
YHP1Q04116 ALD4YOR374W 1560 nt8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms