Protein–RNA interactions for Protein: Q02939

TFB2, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB2, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB2Q02939 YLR464WYLR464W 651 nt11.08□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 CCA1YER168C 1641 nt11.07□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 YLR179CYLR179C 606 nt11.07□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 CRR1YLR213C 1269 nt11.07□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 ERF2YLR246W 1080 nt11.07□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 NAR1YNL240C 1476 nt11.06□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 MRPL8YJL063C 717 nt11.05□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 GAL1YBR020W 1587 nt11.04□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 AAC1YMR056C 930 nt11.04□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 DPS1YLL018C 1674 nt11.04□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 TRM5YHR070W 1500 nt11.04□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 ATF2YGR177C 1608 nt11.03□□□□□ -0.64
TFB2Q02939 MIC10YCL057C-A 294 nt11.02□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 ADO1YJR105W 1023 nt11□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 DDR2YOL052C-A 186 nt10.99□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.98□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.98□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 YFL067WYFL067W 528 nt10.98□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 HUA1YGR268C 597 nt10.98□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 AQY1YPR192W 918 nt10.97□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 RAX1YOR301W 1308 nt10.97□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 BIO5YNR056C 1686 nt10.96□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 HEM12YDR047W 1089 nt10.96□□□□□ -0.65
TFB2Q02939 YPR064WYPR064W 420 nt10.95□□□□□ -0.66
TFB2Q02939 WSC2YNL283C 1512 nt10.94□□□□□ -0.66
TFB2Q02939 SNF1YDR477W 1902 nt10.93□□□□□ -0.66
TFB2Q02939 AHT1YHR093W 549 nt10.92□□□□□ -0.66
TFB2Q02939 STB1YNL309W 1263 nt10.92□□□□□ -0.66
TFB2Q02939 SNG1YGR197C 1644 nt10.91□□□□□ -0.66
TFB2Q02939 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.91□□□□□ -0.66
TFB2Q02939 NME1NME1 340 nt10.91□□□□□ -0.66
TFB2Q02939 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.9□□□□□ -0.66
TFB2Q02939 PBP1YGR178C 2169 nt10.89□□□□□ -0.67
TFB2Q02939 YKR005CYKR005C 1578 nt10.89□□□□□ -0.67
TFB2Q02939 SPC25YER018C 666 nt10.88□□□□□ -0.67
TFB2Q02939 TAD3YLR316C 969 nt10.87□□□□□ -0.67
TFB2Q02939 BMT6YLR063W 1098 nt10.86□□□□□ -0.67
TFB2Q02939 ANP1YEL036C 1503 nt10.84□□□□□ -0.67
TFB2Q02939 GPI16YHR188C 1833 nt10.84□□□□□ -0.67
TFB2Q02939 CCT4YDL143W 1587 nt10.83□□□□□ -0.68
TFB2Q02939 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.82□□□□□ -0.68
TFB2Q02939 FEN2YCR028C 1539 nt10.82□□□□□ -0.68
TFB2Q02939 VPS60YDR486C 690 nt10.81□□□□□ -0.68
TFB2Q02939 CYT2YKL087C 675 nt10.81□□□□□ -0.68
TFB2Q02939 SWC5YBR231C 912 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB2Q02939 AGP1YCL025C 1902 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB2Q02939 ALG3YBL082C 1377 nt10.76□□□□□ -0.69
TFB2Q02939 YGR259CYGR259C 441 nt10.74□□□□□ -0.69
TFB2Q02939 BNA2YJR078W 1362 nt10.74□□□□□ -0.69
TFB2Q02939 YIR016WYIR016W 798 nt10.73□□□□□ -0.69
TFB2Q02939 FRE6YLL051C 2139 nt10.72□□□□□ -0.69
TFB2Q02939 YCL074WYCL074W 927 nt10.72□□□□□ -0.69
TFB2Q02939 IRC24YIR036C 792 nt10.71□□□□□ -0.69
TFB2Q02939 BDH1YAL060W 1149 nt10.71□□□□□ -0.69
TFB2Q02939 DUS1YML080W 1272 nt10.7□□□□□ -0.7
TFB2Q02939 YLR415CYLR415C 339 nt10.69□□□□□ -0.7
TFB2Q02939 CMP2YML057W 1815 nt10.68□□□□□ -0.7
TFB2Q02939 MIC12YBR262C 321 nt10.68□□□□□ -0.7
TFB2Q02939 RPM1RPM1 483 nt10.67□□□□□ -0.7
TFB2Q02939 YSP3YOR003W 1437 nt10.63□□□□□ -0.71
TFB2Q02939 HSL7YBR133C 2484 nt10.61□□□□□ -0.71
TFB2Q02939 YDR094WYDR094W 336 nt10.61□□□□□ -0.71
TFB2Q02939 HHO1YPL127C 777 nt10.61□□□□□ -0.71
TFB2Q02939 UBX6YJL048C 1191 nt10.6□□□□□ -0.71
TFB2Q02939 YAT1YAR035W 2064 nt10.6□□□□□ -0.71
TFB2Q02939 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.58□□□□□ -0.72
TFB2Q02939 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.58□□□□□ -0.72
TFB2Q02939 YFL066CYFL066C 1179 nt10.58□□□□□ -0.72
TFB2Q02939 YNL115CYNL115C 1935 nt10.57□□□□□ -0.72
TFB2Q02939 YFR018CYFR018C 1092 nt10.57□□□□□ -0.72
TFB2Q02939 PEX25YPL112C 1185 nt10.56□□□□□ -0.72
TFB2Q02939 XDJ1YLR090W 1380 nt10.54□□□□□ -0.72
TFB2Q02939 PRE6YOL038W 765 nt10.53□□□□□ -0.72
TFB2Q02939 STR3YGL184C 1398 nt10.52□□□□□ -0.72
TFB2Q02939 GDH3YAL062W 1374 nt10.51□□□□□ -0.73
TFB2Q02939 YGR201CYGR201C 678 nt10.5□□□□□ -0.73
TFB2Q02939 TIM17YJL143W 477 nt10.5□□□□□ -0.73
TFB2Q02939 DUT1YBR252W 444 nt10.5□□□□□ -0.73
TFB2Q02939 SHM2YLR058C 1410 nt10.5□□□□□ -0.73
TFB2Q02939 AVT6YER119C 1347 nt10.45□□□□□ -0.74
TFB2Q02939 RRT5YFR032C 870 nt10.45□□□□□ -0.74
TFB2Q02939 NDI1YML120C 1542 nt10.44□□□□□ -0.74
TFB2Q02939 PAU16YKL224C 372 nt10.42□□□□□ -0.74
TFB2Q02939 VPS75YNL246W 795 nt10.42□□□□□ -0.74
TFB2Q02939 GOR1YNL274C 1053 nt10.42□□□□□ -0.74
TFB2Q02939 AQY2YLL052C 450 nt10.39□□□□□ -0.75
TFB2Q02939 NIT1YIL164C 600 nt10.38□□□□□ -0.75
TFB2Q02939 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.38□□□□□ -0.75
TFB2Q02939 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.38□□□□□ -0.75
TFB2Q02939 SGT2YOR007C 1041 nt10.37□□□□□ -0.75
TFB2Q02939 SPT20YOL148C 1815 nt10.35□□□□□ -0.75
TFB2Q02939 RTN2YDL204W 1182 nt10.33□□□□□ -0.76
TFB2Q02939 PAU7YAR020C 168 nt10.32□□□□□ -0.76
TFB2Q02939 RPC82YPR190C 1965 nt10.31□□□□□ -0.76
TFB2Q02939 DAT1YML113W 747 nt10.27□□□□□ -0.77
TFB2Q02939 MIR1YJR077C 936 nt10.26□□□□□ -0.77
TFB2Q02939 HEL2YDR266C 1920 nt10.25□□□□□ -0.77
TFB2Q02939 YCR102CYCR102C 1107 nt10.24□□□□□ -0.77
TFB2Q02939 INA1YLR413W 2028 nt10.23□□□□□ -0.77
TFB2Q02939 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms