Protein–RNA interactions for Protein: Q02630

NUP116, Nucleoporin NUP116/NSP116, yeastyeast

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP116Q02630 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.94□□□□□ -0.82
NUP116Q02630 YLR235CYLR235C 399 nt9.94□□□□□ -0.82
NUP116Q02630 RTG1YOL067C 534 nt9.94□□□□□ -0.82
NUP116Q02630 YDR094WYDR094W 336 nt9.92□□□□□ -0.82
NUP116Q02630 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.91□□□□□ -0.82
NUP116Q02630 CRR1YLR213C 1269 nt9.91□□□□□ -0.82
NUP116Q02630 PTH1YHR189W 573 nt9.9□□□□□ -0.82
NUP116Q02630 FTR1YER145C 1215 nt9.89□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 PRP4YPR178W 1398 nt9.88□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 AAC1YMR056C 930 nt9.88□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 YFL067WYFL067W 528 nt9.87□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 AQY1YPR192W 918 nt9.86□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 TIM23YNR017W 669 nt9.85□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 RAX1YOR301W 1308 nt9.84□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 GAL1YBR020W 1587 nt9.84□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 CCA1YER168C 1641 nt9.84□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 ATF2YGR177C 1608 nt9.84□□□□□ -0.83
NUP116Q02630 HEM12YDR047W 1089 nt9.83□□□□□ -0.84
NUP116Q02630 YKL030WYKL030W 606 nt9.83□□□□□ -0.84
NUP116Q02630 TRM5YHR070W 1500 nt9.82□□□□□ -0.84
NUP116Q02630 BMT6YLR063W 1098 nt9.82□□□□□ -0.84
NUP116Q02630 NAR1YNL240C 1476 nt9.82□□□□□ -0.84
NUP116Q02630 DPS1YLL018C 1674 nt9.81□□□□□ -0.84
NUP116Q02630 DDR2YOL052C-A 186 nt9.81□□□□□ -0.84
NUP116Q02630 YLR179CYLR179C 606 nt9.8□□□□□ -0.84
NUP116Q02630 HUA1YGR268C 597 nt9.79□□□□□ -0.84
NUP116Q02630 MIC10YCL057C-A 294 nt9.77□□□□□ -0.85
NUP116Q02630 SNG1YGR197C 1644 nt9.77□□□□□ -0.85
NUP116Q02630 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.76□□□□□ -0.85
NUP116Q02630 SPC25YER018C 666 nt9.73□□□□□ -0.85
NUP116Q02630 STB1YNL309W 1263 nt9.73□□□□□ -0.85
NUP116Q02630 AHT1YHR093W 549 nt9.72□□□□□ -0.85
NUP116Q02630 ANP1YEL036C 1503 nt9.72□□□□□ -0.85
NUP116Q02630 YKR005CYKR005C 1578 nt9.71□□□□□ -0.85
NUP116Q02630 YPR064WYPR064W 420 nt9.71□□□□□ -0.86
NUP116Q02630 GPI16YHR188C 1833 nt9.7□□□□□ -0.86
NUP116Q02630 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.7□□□□□ -0.86
NUP116Q02630 WSC2YNL283C 1512 nt9.69□□□□□ -0.86
NUP116Q02630 SBA1YKL117W 651 nt9.67□□□□□ -0.86
NUP116Q02630 BIO5YNR056C 1686 nt9.67□□□□□ -0.86
NUP116Q02630 BNA2YJR078W 1362 nt9.66□□□□□ -0.86
NUP116Q02630 FEN2YCR028C 1539 nt9.65□□□□□ -0.86
NUP116Q02630 CCT4YDL143W 1587 nt9.64□□□□□ -0.87
NUP116Q02630 TAD3YLR316C 969 nt9.64□□□□□ -0.87
NUP116Q02630 DUS1YML080W 1272 nt9.64□□□□□ -0.87
NUP116Q02630 SNF1YDR477W 1902 nt9.63□□□□□ -0.87
NUP116Q02630 VPS60YDR486C 690 nt9.61□□□□□ -0.87
NUP116Q02630 YGR259CYGR259C 441 nt9.61□□□□□ -0.87
NUP116Q02630 CYT2YKL087C 675 nt9.61□□□□□ -0.87
NUP116Q02630 YCL074WYCL074W 927 nt9.6□□□□□ -0.87
NUP116Q02630 SWC5YBR231C 912 nt9.59□□□□□ -0.87
NUP116Q02630 IRC24YIR036C 792 nt9.58□□□□□ -0.88
NUP116Q02630 MIC12YBR262C 321 nt9.58□□□□□ -0.88
NUP116Q02630 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.57□□□□□ -0.88
NUP116Q02630 PBP1YGR178C 2169 nt9.56□□□□□ -0.88
NUP116Q02630 YIR016WYIR016W 798 nt9.56□□□□□ -0.88
NUP116Q02630 ALG3YBL082C 1377 nt9.54□□□□□ -0.88
NUP116Q02630 AGP1YCL025C 1902 nt9.52□□□□□ -0.88
NUP116Q02630 CMP2YML057W 1815 nt9.5□□□□□ -0.89
NUP116Q02630 YLR415CYLR415C 339 nt9.49□□□□□ -0.89
NUP116Q02630 HHO1YPL127C 777 nt9.49□□□□□ -0.89
NUP116Q02630 YGR201CYGR201C 678 nt9.48□□□□□ -0.89
NUP116Q02630 BDH1YAL060W 1149 nt9.48□□□□□ -0.89
NUP116Q02630 PAU16YKL224C 372 nt9.41□□□□□ -0.9
NUP116Q02630 YSP3YOR003W 1437 nt9.4□□□□□ -0.9
NUP116Q02630 XDJ1YLR090W 1380 nt9.39□□□□□ -0.91
NUP116Q02630 TIM17YJL143W 477 nt9.36□□□□□ -0.91
NUP116Q02630 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.35□□□□□ -0.91
NUP116Q02630 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.35□□□□□ -0.91
NUP116Q02630 GDH3YAL062W 1374 nt9.35□□□□□ -0.91
NUP116Q02630 RRT5YFR032C 870 nt9.34□□□□□ -0.91
NUP116Q02630 PEX25YPL112C 1185 nt9.34□□□□□ -0.91
NUP116Q02630 NDI1YML120C 1542 nt9.34□□□□□ -0.91
NUP116Q02630 STR3YGL184C 1398 nt9.34□□□□□ -0.91
NUP116Q02630 YFR018CYFR018C 1092 nt9.33□□□□□ -0.92
NUP116Q02630 AVT6YER119C 1347 nt9.32□□□□□ -0.92
NUP116Q02630 SHM2YLR058C 1410 nt9.32□□□□□ -0.92
NUP116Q02630 YAT1YAR035W 2064 nt9.32□□□□□ -0.92
NUP116Q02630 GOR1YNL274C 1053 nt9.32□□□□□ -0.92
NUP116Q02630 YNL115CYNL115C 1935 nt9.31□□□□□ -0.92
NUP116Q02630 AQY2YLL052C 450 nt9.31□□□□□ -0.92
NUP116Q02630 RTN2YDL204W 1182 nt9.3□□□□□ -0.92
NUP116Q02630 VPS75YNL246W 795 nt9.27□□□□□ -0.93
NUP116Q02630 DUT1YBR252W 444 nt9.25□□□□□ -0.93
NUP116Q02630 YFL066CYFL066C 1179 nt9.23□□□□□ -0.93
NUP116Q02630 DAT1YML113W 747 nt9.23□□□□□ -0.93
NUP116Q02630 NIT1YIL164C 600 nt9.22□□□□□ -0.93
NUP116Q02630 FRE6YLL051C 2139 nt9.2□□□□□ -0.94
NUP116Q02630 SGT2YOR007C 1041 nt9.2□□□□□ -0.94
NUP116Q02630 SPT20YOL148C 1815 nt9.19□□□□□ -0.94
NUP116Q02630 HSL7YBR133C 2484 nt9.17□□□□□ -0.94
NUP116Q02630 YCR102CYCR102C 1107 nt9.17□□□□□ -0.94
NUP116Q02630 INA1YLR413W 2028 nt9.17□□□□□ -0.94
NUP116Q02630 PRE6YOL038W 765 nt9.15□□□□□ -0.94
NUP116Q02630 PAU7YAR020C 168 nt9.12□□□□□ -0.95
NUP116Q02630 NBP35YGL091C 987 nt9.09□□□□□ -0.95
NUP116Q02630 HIF1YLL022C 1158 nt9.09□□□□□ -0.95
NUP116Q02630 RPC82YPR190C 1965 nt9.08□□□□□ -0.96
NUP116Q02630 ALD4YOR374W 1560 nt9.08□□□□□ -0.96
NUP116Q02630 NAT4YMR069W 858 nt9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms