Protein–RNA interactions for Protein: P53958

BOP3, Protein BOP3, yeastyeast

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BOP3P53958 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.66□□□□□ -0.54
BOP3P53958 ANP1YEL036C 1503 nt11.61□□□□□ -0.55
BOP3P53958 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.58□□□□□ -0.56
BOP3P53958 TIM23YNR017W 669 nt11.58□□□□□ -0.56
BOP3P53958 YLR179CYLR179C 606 nt11.57□□□□□ -0.56
BOP3P53958 STB1YNL309W 1263 nt11.57□□□□□ -0.56
BOP3P53958 MOT3YMR070W 1473 nt11.56□□□□□ -0.56
BOP3P53958 YLR235CYLR235C 399 nt11.54□□□□□ -0.56
BOP3P53958 AGP1YCL025C 1902 nt11.54□□□□□ -0.56
BOP3P53958 FEN2YCR028C 1539 nt11.54□□□□□ -0.56
BOP3P53958 BNA2YJR078W 1362 nt11.54□□□□□ -0.56
BOP3P53958 AQY1YPR192W 918 nt11.53□□□□□ -0.56
BOP3P53958 SPC25YER018C 666 nt11.52□□□□□ -0.57
BOP3P53958 UME6YDR207C 2511 nt11.5□□□□□ -0.57
BOP3P53958 MIC12YBR262C 321 nt11.49□□□□□ -0.57
BOP3P53958 PRP4YPR178W 1398 nt11.48□□□□□ -0.57
BOP3P53958 WSC2YNL283C 1512 nt11.48□□□□□ -0.57
BOP3P53958 ALG12YNR030W 1656 nt11.47□□□□□ -0.57
BOP3P53958 VPS60YDR486C 690 nt11.47□□□□□ -0.57
BOP3P53958 GPI16YHR188C 1833 nt11.46□□□□□ -0.58
BOP3P53958 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.45□□□□□ -0.58
BOP3P53958 YEL076CYEL076C 651 nt11.45□□□□□ -0.58
BOP3P53958 YIR016WYIR016W 798 nt11.45□□□□□ -0.58
BOP3P53958 YLR464WYLR464W 651 nt11.45□□□□□ -0.58
BOP3P53958 ALG3YBL082C 1377 nt11.44□□□□□ -0.58
BOP3P53958 HHO1YPL127C 777 nt11.44□□□□□ -0.58
BOP3P53958 CCT4YDL143W 1587 nt11.44□□□□□ -0.58
BOP3P53958 AHT1YHR093W 549 nt11.43□□□□□ -0.58
BOP3P53958 DUS1YML080W 1272 nt11.43□□□□□ -0.58
BOP3P53958 DPS1YLL018C 1674 nt11.43□□□□□ -0.58
BOP3P53958 YKL030WYKL030W 606 nt11.42□□□□□ -0.58
BOP3P53958 YKR005CYKR005C 1578 nt11.37□□□□□ -0.59
BOP3P53958 DUT1YBR252W 444 nt11.37□□□□□ -0.59
BOP3P53958 MCH5YOR306C 1566 nt11.37□□□□□ -0.59
BOP3P53958 SWC5YBR231C 912 nt11.36□□□□□ -0.59
BOP3P53958 YCL074WYCL074W 927 nt11.34□□□□□ -0.59
BOP3P53958 AAC1YMR056C 930 nt11.34□□□□□ -0.59
BOP3P53958 XDJ1YLR090W 1380 nt11.33□□□□□ -0.6
BOP3P53958 YPR064WYPR064W 420 nt11.33□□□□□ -0.6
BOP3P53958 SNF1YDR477W 1902 nt11.31□□□□□ -0.6
BOP3P53958 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.3□□□□□ -0.6
BOP3P53958 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.3□□□□□ -0.6
BOP3P53958 BMT6YLR063W 1098 nt11.27□□□□□ -0.61
BOP3P53958 TAD3YLR316C 969 nt11.27□□□□□ -0.61
BOP3P53958 BIO5YNR056C 1686 nt11.27□□□□□ -0.61
BOP3P53958 YGR259CYGR259C 441 nt11.26□□□□□ -0.61
BOP3P53958 YGR201CYGR201C 678 nt11.25□□□□□ -0.61
BOP3P53958 STR3YGL184C 1398 nt11.24□□□□□ -0.61
BOP3P53958 RTG1YOL067C 534 nt11.23□□□□□ -0.61
BOP3P53958 AVT6YER119C 1347 nt11.21□□□□□ -0.61
BOP3P53958 NAR1YNL240C 1476 nt11.2□□□□□ -0.62
BOP3P53958 GDH3YAL062W 1374 nt11.19□□□□□ -0.62
BOP3P53958 BDH1YAL060W 1149 nt11.19□□□□□ -0.62
BOP3P53958 AQY2YLL052C 450 nt11.19□□□□□ -0.62
BOP3P53958 GOR1YNL274C 1053 nt11.15□□□□□ -0.62
BOP3P53958 SHM2YLR058C 1410 nt11.12□□□□□ -0.63
BOP3P53958 IRC24YIR036C 792 nt11.12□□□□□ -0.63
BOP3P53958 YLR415CYLR415C 339 nt11.11□□□□□ -0.63
BOP3P53958 PBP1YGR178C 2169 nt11.1□□□□□ -0.63
BOP3P53958 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.05□□□□□ -0.64
BOP3P53958 YSP3YOR003W 1437 nt11.03□□□□□ -0.64
BOP3P53958 NIT1YIL164C 600 nt11□□□□□ -0.65
BOP3P53958 TIM17YJL143W 477 nt10.99□□□□□ -0.65
BOP3P53958 CYT2YKL087C 675 nt10.99□□□□□ -0.65
BOP3P53958 RTN2YDL204W 1182 nt10.97□□□□□ -0.65
BOP3P53958 HUA1YGR268C 597 nt10.96□□□□□ -0.65
BOP3P53958 YNL115CYNL115C 1935 nt10.94□□□□□ -0.66
BOP3P53958 SGT2YOR007C 1041 nt10.93□□□□□ -0.66
BOP3P53958 DAT1YML113W 747 nt10.91□□□□□ -0.66
BOP3P53958 PLB1YMR008C 1995 nt10.9□□□□□ -0.66
BOP3P53958 NBP35YGL091C 987 nt10.9□□□□□ -0.66
BOP3P53958 YFL066CYFL066C 1179 nt10.89□□□□□ -0.67
BOP3P53958 YAT1YAR035W 2064 nt10.86□□□□□ -0.67
BOP3P53958 YCR102CYCR102C 1107 nt10.86□□□□□ -0.67
BOP3P53958 PEX25YPL112C 1185 nt10.84□□□□□ -0.67
BOP3P53958 PRM5YIL117C 957 nt10.81□□□□□ -0.68
BOP3P53958 ARP6YLR085C 1317 nt10.8□□□□□ -0.68
BOP3P53958 MRPL8YJL063C 717 nt10.78□□□□□ -0.68
BOP3P53958 HIF1YLL022C 1158 nt10.77□□□□□ -0.69
BOP3P53958 ADO1YJR105W 1023 nt10.75□□□□□ -0.69
BOP3P53958 SHH4YLR164W 507 nt10.75□□□□□ -0.69
BOP3P53958 VPS75YNL246W 795 nt10.74□□□□□ -0.69
BOP3P53958 CMP2YML057W 1815 nt10.73□□□□□ -0.69
BOP3P53958 UTR1YJR049C 1593 nt10.73□□□□□ -0.69
BOP3P53958 YJL225CYJL225C 5277 nt10.71□□□□□ -0.69
BOP3P53958 PRE6YOL038W 765 nt10.71□□□□□ -0.69
BOP3P53958 ALD4YOR374W 1560 nt10.69□□□□□ -0.7
BOP3P53958 PRO1YDR300C 1287 nt10.67□□□□□ -0.7
BOP3P53958 GAP1YKR039W 1809 nt10.67□□□□□ -0.7
BOP3P53958 TIR3YIL011W 810 nt10.65□□□□□ -0.7
BOP3P53958 YFR018CYFR018C 1092 nt10.64□□□□□ -0.71
BOP3P53958 PAU7YAR020C 168 nt10.61□□□□□ -0.71
BOP3P53958 YDR010CYDR010C 333 nt10.6□□□□□ -0.71
BOP3P53958 LSC2YGR244C 1284 nt10.59□□□□□ -0.71
BOP3P53958 POM34YLR018C 900 nt10.59□□□□□ -0.71
BOP3P53958 RPC82YPR190C 1965 nt10.59□□□□□ -0.71
BOP3P53958 NDI1YML120C 1542 nt10.58□□□□□ -0.72
BOP3P53958 SFA1YDL168W 1161 nt10.57□□□□□ -0.72
BOP3P53958 ATG15YCR068W 1563 nt10.56□□□□□ -0.72
BOP3P53958 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.56□□□□□ -0.72
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