Protein–RNA interactions for Protein: P47023

TY4A-J, Transposon Ty4-J Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4A-JP47023 BIO4YNR057C 714 nt10.8□□□□□ -0.68
TY4A-JP47023 WSC2YNL283C 1512 nt10.79□□□□□ -0.68
TY4A-JP47023 ESBP6YNL125C 2022 nt10.79□□□□□ -0.68
TY4A-JP47023 HSP60YLR259C 1719 nt10.79□□□□□ -0.68
TY4A-JP47023 YLR179CYLR179C 606 nt10.78□□□□□ -0.68
TY4A-JP47023 ALG12YNR030W 1656 nt10.78□□□□□ -0.68
TY4A-JP47023 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.76□□□□□ -0.69
TY4A-JP47023 AHT1YHR093W 549 nt10.76□□□□□ -0.69
TY4A-JP47023 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.75□□□□□ -0.69
TY4A-JP47023 YLL053CYLL053C 459 nt10.75□□□□□ -0.69
TY4A-JP47023 SWE1YJL187C 2460 nt10.73□□□□□ -0.69
TY4A-JP47023 SIM1YIL123W 1431 nt10.73□□□□□ -0.69
TY4A-JP47023 MCH5YOR306C 1566 nt10.73□□□□□ -0.69
TY4A-JP47023 FTR1YER145C 1215 nt10.71□□□□□ -0.69
TY4A-JP47023 YPR064WYPR064W 420 nt10.71□□□□□ -0.69
TY4A-JP47023 YFR018CYFR018C 1092 nt10.7□□□□□ -0.7
TY4A-JP47023 TAD3YLR316C 969 nt10.69□□□□□ -0.7
TY4A-JP47023 NME1NME1 340 nt10.69□□□□□ -0.7
TY4A-JP47023 GAL1YBR020W 1587 nt10.68□□□□□ -0.7
TY4A-JP47023 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.66□□□□□ -0.7
TY4A-JP47023 AQY1YPR192W 918 nt10.66□□□□□ -0.7
TY4A-JP47023 GLK1YCL040W 1503 nt10.64□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 PRE6YOL038W 765 nt10.64□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 MCM5YLR274W 2328 nt10.63□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 TRM5YHR070W 1500 nt10.63□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 HEM14YER014W 1620 nt10.62□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 ATF2YGR177C 1608 nt10.62□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 MAS1YLR163C 1389 nt10.61□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 PAU16YKL224C 372 nt10.6□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 SPC25YER018C 666 nt10.59□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 BDH1YAL060W 1149 nt10.59□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 LYS4YDR234W 2082 nt10.59□□□□□ -0.71
TY4A-JP47023 DTR1YBR180W 1719 nt10.58□□□□□ -0.72
TY4A-JP47023 CRR1YLR213C 1269 nt10.57□□□□□ -0.72
TY4A-JP47023 ERF2YLR246W 1080 nt10.57□□□□□ -0.72
TY4A-JP47023 YSP3YOR003W 1437 nt10.56□□□□□ -0.72
TY4A-JP47023 STB1YNL309W 1263 nt10.55□□□□□ -0.72
TY4A-JP47023 YFL067WYFL067W 528 nt10.53□□□□□ -0.72
TY4A-JP47023 CCT4YDL143W 1587 nt10.52□□□□□ -0.72
TY4A-JP47023 YFL066CYFL066C 1179 nt10.52□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 PEX25YPL112C 1185 nt10.52□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 ILV2YMR108W 2064 nt10.51□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 RRT5YFR032C 870 nt10.51□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.5□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 ANP1YEL036C 1503 nt10.49□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 DDR2YOL052C-A 186 nt10.49□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.48□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 VPS60YDR486C 690 nt10.48□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 GPI16YHR188C 1833 nt10.48□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 SNG1YGR197C 1644 nt10.47□□□□□ -0.73
TY4A-JP47023 ALG3YBL082C 1377 nt10.46□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 FUR4YBR021W 1902 nt10.46□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 YLR415CYLR415C 339 nt10.45□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 MIC10YCL057C-A 294 nt10.45□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 RFC1YOR217W 2586 nt10.45□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 YNL115CYNL115C 1935 nt10.45□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 AAC1YMR056C 930 nt10.44□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 FEN2YCR028C 1539 nt10.43□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 RSC4YKR008W 1878 nt10.43□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 NPP1YCR026C 2229 nt10.42□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 PRP4YPR178W 1398 nt10.4□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 HEM12YDR047W 1089 nt10.4□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 NAR1YNL240C 1476 nt10.4□□□□□ -0.74
TY4A-JP47023 SWC5YBR231C 912 nt10.38□□□□□ -0.75
TY4A-JP47023 SBA1YKL117W 651 nt10.35□□□□□ -0.75
TY4A-JP47023 YIR016WYIR016W 798 nt10.34□□□□□ -0.75
TY4A-JP47023 DPS1YLL018C 1674 nt10.33□□□□□ -0.76
TY4A-JP47023 MET2YNL277W 1461 nt10.32□□□□□ -0.76
TY4A-JP47023 VPS75YNL246W 795 nt10.31□□□□□ -0.76
TY4A-JP47023 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.3□□□□□ -0.76
TY4A-JP47023 MIR1YJR077C 936 nt10.29□□□□□ -0.76
TY4A-JP47023 BMT6YLR063W 1098 nt10.29□□□□□ -0.76
TY4A-JP47023 SFP1YLR403W 2052 nt10.27□□□□□ -0.76
TY4A-JP47023 YAT1YAR035W 2064 nt10.27□□□□□ -0.77
TY4A-JP47023 MIC12YBR262C 321 nt10.26□□□□□ -0.77
TY4A-JP47023 NAT4YMR069W 858 nt10.24□□□□□ -0.77
TY4A-JP47023 CYT2YKL087C 675 nt10.23□□□□□ -0.77
TY4A-JP47023 YDR306CYDR306C 1437 nt10.23□□□□□ -0.77
TY4A-JP47023 CCA1YER168C 1641 nt10.22□□□□□ -0.77
TY4A-JP47023 PBP1YGR178C 2169 nt10.22□□□□□ -0.77
TY4A-JP47023 BIO5YNR056C 1686 nt10.22□□□□□ -0.77
TY4A-JP47023 RAX1YOR301W 1308 nt10.21□□□□□ -0.78
TY4A-JP47023 MSF1YPR047W 1410 nt10.2□□□□□ -0.78
TY4A-JP47023 SHM2YLR058C 1410 nt10.19□□□□□ -0.78
TY4A-JP47023 THI74YDR438W 1113 nt10.19□□□□□ -0.78
TY4A-JP47023 YKR005CYKR005C 1578 nt10.18□□□□□ -0.78
TY4A-JP47023 TIM17YJL143W 477 nt10.17□□□□□ -0.78
TY4A-JP47023 XDJ1YLR090W 1380 nt10.16□□□□□ -0.78
TY4A-JP47023 NIT1YIL164C 600 nt10.15□□□□□ -0.78
TY4A-JP47023 SNF1YDR477W 1902 nt10.15□□□□□ -0.79
TY4A-JP47023 GAL2YLR081W 1725 nt10.14□□□□□ -0.79
TY4A-JP47023 BNA2YJR078W 1362 nt10.13□□□□□ -0.79
TY4A-JP47023 IRC24YIR036C 792 nt10.12□□□□□ -0.79
TY4A-JP47023 CMP2YML057W 1815 nt10.12□□□□□ -0.79
TY4A-JP47023 DAT1YML113W 747 nt10.11□□□□□ -0.79
TY4A-JP47023 GTB1YDR221W 2109 nt10.09□□□□□ -0.79
TY4A-JP47023 YGR201CYGR201C 678 nt10.09□□□□□ -0.79
TY4A-JP47023 GNP1YDR508C 1992 nt10.08□□□□□ -0.8
TY4A-JP47023 YDR010CYDR010C 333 nt10.08□□□□□ -0.8
TY4A-JP47023 SGT2YOR007C 1041 nt10.08□□□□□ -0.8
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