Protein–RNA interactions for Protein: P40072

SLX8, E3 ubiquitin-protein ligase complex SLX5-SLX8 subunit SLX8, yeastyeast

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX8P40072 UBX6YJL048C 1191 nt11.3□□□□□ -0.6
SLX8P40072 REG2YBR050C 1017 nt11.3□□□□□ -0.6
SLX8P40072 YLR235CYLR235C 399 nt11.29□□□□□ -0.6
SLX8P40072 BIO4YNR057C 714 nt11.29□□□□□ -0.6
SLX8P40072 RTF1YGL244W 1677 nt11.27□□□□□ -0.6
SLX8P40072 SIM1YIL123W 1431 nt11.26□□□□□ -0.61
SLX8P40072 DIC1YLR348C 897 nt11.26□□□□□ -0.61
SLX8P40072 PAM17YKR065C 594 nt11.25□□□□□ -0.61
SLX8P40072 BOP3YNL042W 1191 nt11.25□□□□□ -0.61
SLX8P40072 YKL030WYKL030W 606 nt11.24□□□□□ -0.61
SLX8P40072 PUS7YOR243C 2031 nt11.22□□□□□ -0.61
SLX8P40072 YLL053CYLL053C 459 nt11.21□□□□□ -0.61
SLX8P40072 YPL041CYPL041C 624 nt11.21□□□□□ -0.61
SLX8P40072 HUA1YGR268C 597 nt11.2□□□□□ -0.62
SLX8P40072 PTK1YKL198C 1989 nt11.18□□□□□ -0.62
SLX8P40072 TIM23YNR017W 669 nt11.18□□□□□ -0.62
SLX8P40072 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.17□□□□□ -0.62
SLX8P40072 LYS4YDR234W 2082 nt11.16□□□□□ -0.62
SLX8P40072 FTR1YER145C 1215 nt11.14□□□□□ -0.63
SLX8P40072 GAL1YBR020W 1587 nt11.11□□□□□ -0.63
SLX8P40072 WSC2YNL283C 1512 nt11.1□□□□□ -0.63
SLX8P40072 AHT1YHR093W 549 nt11.09□□□□□ -0.63
SLX8P40072 YLR179CYLR179C 606 nt11.09□□□□□ -0.63
SLX8P40072 CRR1YLR213C 1269 nt11.09□□□□□ -0.63
SLX8P40072 ERF2YLR246W 1080 nt11.09□□□□□ -0.63
SLX8P40072 ATF2YGR177C 1608 nt11.09□□□□□ -0.63
SLX8P40072 UME6YDR207C 2511 nt11.08□□□□□ -0.64
SLX8P40072 YNL115CYNL115C 1935 nt11.07□□□□□ -0.64
SLX8P40072 COG1YGL223C 1254 nt11.07□□□□□ -0.64
SLX8P40072 TRM5YHR070W 1500 nt11.06□□□□□ -0.64
SLX8P40072 YJL225CYJL225C 5277 nt11.06□□□□□ -0.64
SLX8P40072 AQY1YPR192W 918 nt11.06□□□□□ -0.64
SLX8P40072 YFL067WYFL067W 528 nt11.01□□□□□ -0.65
SLX8P40072 YPR064WYPR064W 420 nt11□□□□□ -0.65
SLX8P40072 SPC25YER018C 666 nt10.99□□□□□ -0.65
SLX8P40072 TAD3YLR316C 969 nt10.98□□□□□ -0.65
SLX8P40072 STB1YNL309W 1263 nt10.97□□□□□ -0.65
SLX8P40072 LCP5YER127W 1074 nt10.96□□□□□ -0.65
SLX8P40072 ARA2YMR041C 1008 nt10.96□□□□□ -0.65
SLX8P40072 SNG1YGR197C 1644 nt10.95□□□□□ -0.66
SLX8P40072 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.95□□□□□ -0.66
SLX8P40072 URH1YDR400W 1023 nt10.95□□□□□ -0.66
SLX8P40072 DDR2YOL052C-A 186 nt10.95□□□□□ -0.66
SLX8P40072 MIC10YCL057C-A 294 nt10.95□□□□□ -0.66
SLX8P40072 ANP1YEL036C 1503 nt10.94□□□□□ -0.66
SLX8P40072 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.94□□□□□ -0.66
SLX8P40072 HEM12YDR047W 1089 nt10.93□□□□□ -0.66
SLX8P40072 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.91□□□□□ -0.66
SLX8P40072 FTH1YBR207W 1398 nt10.9□□□□□ -0.66
SLX8P40072 BUR6YER159C 429 nt10.9□□□□□ -0.66
SLX8P40072 CCT4YDL143W 1587 nt10.9□□□□□ -0.67
SLX8P40072 YFL054CYFL054C 1941 nt10.88□□□□□ -0.67
SLX8P40072 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.88□□□□□ -0.67
SLX8P40072 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.88□□□□□ -0.67
SLX8P40072 BDH1YAL060W 1149 nt10.88□□□□□ -0.67
SLX8P40072 GPI16YHR188C 1833 nt10.88□□□□□ -0.67
SLX8P40072 YDR094WYDR094W 336 nt10.87□□□□□ -0.67
SLX8P40072 FEN2YCR028C 1539 nt10.87□□□□□ -0.67
SLX8P40072 VPS60YDR486C 690 nt10.86□□□□□ -0.67
SLX8P40072 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.86□□□□□ -0.67
SLX8P40072 FAF1YIL019W 1041 nt10.85□□□□□ -0.67
SLX8P40072 YLR122CYLR122C 378 nt10.84□□□□□ -0.67
SLX8P40072 ALG3YBL082C 1377 nt10.84□□□□□ -0.67
SLX8P40072 SPT8YLR055C 1809 nt10.84□□□□□ -0.67
SLX8P40072 YJL118WYJL118W 660 nt10.83□□□□□ -0.68
SLX8P40072 YSP3YOR003W 1437 nt10.82□□□□□ -0.68
SLX8P40072 HEM14YER014W 1620 nt10.81□□□□□ -0.68
SLX8P40072 YFR018CYFR018C 1092 nt10.81□□□□□ -0.68
SLX8P40072 YTH1YPR107C 627 nt10.81□□□□□ -0.68
SLX8P40072 YIR016WYIR016W 798 nt10.79□□□□□ -0.68
SLX8P40072 MIC12YBR262C 321 nt10.76□□□□□ -0.69
SLX8P40072 YLR415CYLR415C 339 nt10.75□□□□□ -0.69
SLX8P40072 SWC5YBR231C 912 nt10.75□□□□□ -0.69
SLX8P40072 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.74□□□□□ -0.69
SLX8P40072 RAX1YOR301W 1308 nt10.74□□□□□ -0.69
SLX8P40072 BMT5YIL096C 1011 nt10.72□□□□□ -0.69
SLX8P40072 PUS5YLR165C 765 nt10.72□□□□□ -0.69
SLX8P40072 PRE6YOL038W 765 nt10.72□□□□□ -0.69
SLX8P40072 ABZ2YMR289W 1125 nt10.71□□□□□ -0.69
SLX8P40072 PEX25YPL112C 1185 nt10.71□□□□□ -0.69
SLX8P40072 SWE1YJL187C 2460 nt10.7□□□□□ -0.7
SLX8P40072 ESBP6YNL125C 2022 nt10.7□□□□□ -0.7
SLX8P40072 GID7YCL039W 2238 nt10.69□□□□□ -0.7
SLX8P40072 YFL066CYFL066C 1179 nt10.69□□□□□ -0.7
SLX8P40072 RRT5YFR032C 870 nt10.69□□□□□ -0.7
SLX8P40072 FHN1YGR131W 525 nt10.69□□□□□ -0.7
SLX8P40072 KDX1YKL161C 1302 nt10.68□□□□□ -0.7
SLX8P40072 SRN2YLR119W 642 nt10.66□□□□□ -0.7
SLX8P40072 TOM20YGR082W 552 nt10.65□□□□□ -0.7
SLX8P40072 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt10.65□□□□□ -0.7
SLX8P40072 BNA2YJR078W 1362 nt10.64□□□□□ -0.71
SLX8P40072 CBK1YNL161W 2271 nt10.62□□□□□ -0.71
SLX8P40072 GNP1YDR508C 1992 nt10.62□□□□□ -0.71
SLX8P40072 PAU16YKL224C 372 nt10.61□□□□□ -0.71
SLX8P40072 CCA1YER168C 1641 nt10.61□□□□□ -0.71
SLX8P40072 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.6□□□□□ -0.71
SLX8P40072 MLS1YNL117W 1665 nt10.6□□□□□ -0.71
SLX8P40072 AGP1YCL025C 1902 nt10.57□□□□□ -0.72
SLX8P40072 YGR201CYGR201C 678 nt10.56□□□□□ -0.72
SLX8P40072 VPS75YNL246W 795 nt10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms