RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: P28737
MSP1, Protein MSP1, yeast
Predictions only
Length
362 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
MSP1
P28737
DDR2
YOL052C-A
186 nt
12.58
□□□□□ -0.4
MSP1
P28737
YEL076C-A
YEL076C-A
651 nt
12.54
□□□□□ -0.4
MSP1
P28737
YEL076C
YEL076C
651 nt
12.54
□□□□□ -0.4
MSP1
P28737
YLR464W
YLR464W
651 nt
12.54
□□□□□ -0.4
MSP1
P28737
YDL086C-A
YDL086C-A
435 nt
12.53
□□□□□ -0.4
MSP1
P28737
DPS1
YLL018C
1674 nt
12.51
□□□□□ -0.41
MSP1
P28737
AAC1
YMR056C
930 nt
12.49
□□□□□ -0.41
MSP1
P28737
ANP1
YEL036C
1503 nt
12.48
□□□□□ -0.41
MSP1
P28737
AGP1
YCL025C
1902 nt
12.48
□□□□□ -0.41
MSP1
P28737
Q0182
Q0182
405 nt
12.47
□□□□□ -0.41
MSP1
P28737
BNA2
YJR078W
1362 nt
12.45
□□□□□ -0.42
MSP1
P28737
YKR005C
YKR005C
1578 nt
12.43
□□□□□ -0.42
MSP1
P28737
PTH1
YHR189W
573 nt
12.42
□□□□□ -0.42
MSP1
P28737
MIC12
YBR262C
321 nt
12.42
□□□□□ -0.42
MSP1
P28737
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
12.4
□□□□□ -0.42
MSP1
P28737
STB1
YNL309W
1263 nt
12.4
□□□□□ -0.42
MSP1
P28737
SNF1
YDR477W
1902 nt
12.39
□□□□□ -0.43
MSP1
P28737
DUS1
YML080W
1272 nt
12.39
□□□□□ -0.43
MSP1
P28737
NAR1
YNL240C
1476 nt
12.39
□□□□□ -0.43
MSP1
P28737
BIO5
YNR056C
1686 nt
12.38
□□□□□ -0.43
MSP1
P28737
FEN2
YCR028C
1539 nt
12.37
□□□□□ -0.43
MSP1
P28737
AQY1
YPR192W
918 nt
12.37
□□□□□ -0.43
MSP1
P28737
WSC2
YNL283C
1512 nt
12.37
□□□□□ -0.43
MSP1
P28737
BMT6
YLR063W
1098 nt
12.36
□□□□□ -0.43
MSP1
P28737
SPC25
YER018C
666 nt
12.34
□□□□□ -0.43
MSP1
P28737
YCL074W
YCL074W
927 nt
12.33
□□□□□ -0.44
MSP1
P28737
TIM23
YNR017W
669 nt
12.32
□□□□□ -0.44
MSP1
P28737
HHO1
YPL127C
777 nt
12.32
□□□□□ -0.44
MSP1
P28737
YLR179C
YLR179C
606 nt
12.31
□□□□□ -0.44
MSP1
P28737
SPP1
YPL138C
1062 nt
12.31
□□□□□ -0.44
MSP1
P28737
YGR259C
YGR259C
441 nt
12.29
□□□□□ -0.44
MSP1
P28737
GPI16
YHR188C
1833 nt
12.28
□□□□□ -0.44
MSP1
P28737
VPS60
YDR486C
690 nt
12.28
□□□□□ -0.44
MSP1
P28737
YIR016W
YIR016W
798 nt
12.28
□□□□□ -0.44
MSP1
P28737
ALG3
YBL082C
1377 nt
12.25
□□□□□ -0.45
MSP1
P28737
YLR235C
YLR235C
399 nt
12.24
□□□□□ -0.45
MSP1
P28737
DUT1
YBR252W
444 nt
12.24
□□□□□ -0.45
MSP1
P28737
XDJ1
YLR090W
1380 nt
12.23
□□□□□ -0.45
MSP1
P28737
RDN18-1
RDN18-1
1800 nt
12.23
□□□□□ -0.45
MSP1
P28737
RDN18-2
RDN18-2
1800 nt
12.23
□□□□□ -0.45
MSP1
P28737
CCT4
YDL143W
1587 nt
12.22
□□□□□ -0.45
MSP1
P28737
PBP1
YGR178C
2169 nt
12.22
□□□□□ -0.45
MSP1
P28737
YJL225C
YJL225C
5277 nt
12.2
□□□□□ -0.46
MSP1
P28737
IRC24
YIR036C
792 nt
12.18
□□□□□ -0.46
MSP1
P28737
AHT1
YHR093W
549 nt
12.17
□□□□□ -0.46
MSP1
P28737
STR3
YGL184C
1398 nt
12.17
□□□□□ -0.46
MSP1
P28737
SWC5
YBR231C
912 nt
12.15
□□□□□ -0.46
MSP1
P28737
YGR201C
YGR201C
678 nt
12.14
□□□□□ -0.47
MSP1
P28737
CYT2
YKL087C
675 nt
12.14
□□□□□ -0.47
MSP1
P28737
YKL030W
YKL030W
606 nt
12.08
□□□□□ -0.48
MSP1
P28737
AQY2
YLL052C
450 nt
12.07
□□□□□ -0.48
MSP1
P28737
YPR064W
YPR064W
420 nt
12.04
□□□□□ -0.48
MSP1
P28737
AVT6
YER119C
1347 nt
12.04
□□□□□ -0.48
MSP1
P28737
GOR1
YNL274C
1053 nt
12
□□□□□ -0.49
MSP1
P28737
GDH3
YAL062W
1374 nt
12
□□□□□ -0.49
MSP1
P28737
TAD3
YLR316C
969 nt
11.97
□□□□□ -0.49
MSP1
P28737
YAT1
YAR035W
2064 nt
11.95
□□□□□ -0.5
MSP1
P28737
MOT3
YMR070W
1473 nt
11.93
□□□□□ -0.5
MSP1
P28737
RTN2
YDL204W
1182 nt
11.92
□□□□□ -0.5
MSP1
P28737
CMP2
YML057W
1815 nt
11.9
□□□□□ -0.5
MSP1
P28737
BDH1
YAL060W
1149 nt
11.89
□□□□□ -0.51
MSP1
P28737
SHM2
YLR058C
1410 nt
11.88
□□□□□ -0.51
MSP1
P28737
YLR415C
YLR415C
339 nt
11.81
□□□□□ -0.52
MSP1
P28737
PLB1
YMR008C
1995 nt
11.78
□□□□□ -0.52
MSP1
P28737
NIT1
YIL164C
600 nt
11.76
□□□□□ -0.53
MSP1
P28737
TIM17
YJL143W
477 nt
11.74
□□□□□ -0.53
MSP1
P28737
RTG1
YOL067C
534 nt
11.74
□□□□□ -0.53
MSP1
P28737
PRM5
YIL117C
957 nt
11.73
□□□□□ -0.53
MSP1
P28737
DAT1
YML113W
747 nt
11.73
□□□□□ -0.53
MSP1
P28737
NBP35
YGL091C
987 nt
11.72
□□□□□ -0.53
MSP1
P28737
HIF1
YLL022C
1158 nt
11.72
□□□□□ -0.53
MSP1
P28737
NDI1
YML120C
1542 nt
11.71
□□□□□ -0.53
MSP1
P28737
HSL7
YBR133C
2484 nt
11.7
□□□□□ -0.54
MSP1
P28737
YSP3
YOR003W
1437 nt
11.7
□□□□□ -0.54
MSP1
P28737
tL(GAG)G
tL(GAG)G
82 nt
11.69
□□□□□ -0.54
MSP1
P28737
SGT2
YOR007C
1041 nt
11.68
□□□□□ -0.54
MSP1
P28737
ARP6
YLR085C
1317 nt
11.67
□□□□□ -0.54
MSP1
P28737
YCR102C
YCR102C
1107 nt
11.65
□□□□□ -0.54
MSP1
P28737
ALD4
YOR374W
1560 nt
11.64
□□□□□ -0.55
MSP1
P28737
RPC82
YPR190C
1965 nt
11.63
□□□□□ -0.55
MSP1
P28737
SPT20
YOL148C
1815 nt
11.61
□□□□□ -0.55
MSP1
P28737
UTR1
YJR049C
1593 nt
11.58
□□□□□ -0.55
MSP1
P28737
YNL115C
YNL115C
1935 nt
11.58
□□□□□ -0.56
MSP1
P28737
INA1
YLR413W
2028 nt
11.57
□□□□□ -0.56
MSP1
P28737
SHH4
YLR164W
507 nt
11.5
□□□□□ -0.57
MSP1
P28737
GAP1
YKR039W
1809 nt
11.49
□□□□□ -0.57
MSP1
P28737
HUA1
YGR268C
597 nt
11.47
□□□□□ -0.57
MSP1
P28737
PEX25
YPL112C
1185 nt
11.47
□□□□□ -0.57
MSP1
P28737
PRO1
YDR300C
1287 nt
11.45
□□□□□ -0.58
MSP1
P28737
YFL066C
YFL066C
1179 nt
11.45
□□□□□ -0.58
MSP1
P28737
TIR3
YIL011W
810 nt
11.44
□□□□□ -0.58
MSP1
P28737
LSC2
YGR244C
1284 nt
11.41
□□□□□ -0.58
MSP1
P28737
ZRT3
YKL175W
1512 nt
11.4
□□□□□ -0.58
MSP1
P28737
VPS75
YNL246W
795 nt
11.39
□□□□□ -0.59
MSP1
P28737
RDN25-1
RDN25-1
3396 nt
11.38
□□□□□ -0.59
MSP1
P28737
RDN25-2
RDN25-2
3396 nt
11.38
□□□□□ -0.59
MSP1
P28737
SAM35
YHR083W
990 nt
11.37
□□□□□ -0.59
MSP1
P28737
YJL067W
YJL067W
351 nt
11.36
□□□□□ -0.59
MSP1
P28737
POM34
YLR018C
900 nt
11.36
□□□□□ -0.59
MSP1
P28737
MUP1
YGR055W
1725 nt
11.35
□□□□□ -0.59
First
Previous
3
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.1 ms