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Protein–RNA interactions for Protein: P25042
ROX1, Repressor ROX1, yeast
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368 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ROX1
P25042
SNF1
YDR477W
1902 nt
12.58
□□□□□ -0.4
ROX1
P25042
YKR005C
YKR005C
1578 nt
12.56
□□□□□ -0.4
ROX1
P25042
DDR2
YOL052C-A
186 nt
12.56
□□□□□ -0.4
ROX1
P25042
AGP1
YCL025C
1902 nt
12.54
□□□□□ -0.4
ROX1
P25042
DIC1
YLR348C
897 nt
12.53
□□□□□ -0.4
ROX1
P25042
ERV46
YAL042W
1248 nt
12.52
□□□□□ -0.41
ROX1
P25042
BMT6
YLR063W
1098 nt
12.52
□□□□□ -0.41
ROX1
P25042
YDL086C-A
YDL086C-A
435 nt
12.51
□□□□□ -0.41
ROX1
P25042
YKR040C
YKR040C
504 nt
12.51
□□□□□ -0.41
ROX1
P25042
DUS1
YML080W
1272 nt
12.48
□□□□□ -0.41
ROX1
P25042
ANP1
YEL036C
1503 nt
12.47
□□□□□ -0.41
ROX1
P25042
WSC2
YNL283C
1512 nt
12.47
□□□□□ -0.41
ROX1
P25042
BNA2
YJR078W
1362 nt
12.47
□□□□□ -0.41
ROX1
P25042
PBP1
YGR178C
2169 nt
12.45
□□□□□ -0.42
ROX1
P25042
MIC12
YBR262C
321 nt
12.43
□□□□□ -0.42
ROX1
P25042
YCL074W
YCL074W
927 nt
12.42
□□□□□ -0.42
ROX1
P25042
tM(CAU)C
tM(CAU)C
72 nt
12.42
□□□□□ -0.42
ROX1
P25042
IMT4
tM(CAU)E
72 nt
12.42
□□□□□ -0.42
ROX1
P25042
IMT3
tM(CAU)J3
72 nt
12.42
□□□□□ -0.42
ROX1
P25042
IMT1
tM(CAU)O1
72 nt
12.42
□□□□□ -0.42
ROX1
P25042
IMT2
tM(CAU)P
72 nt
12.42
□□□□□ -0.42
ROX1
P25042
YGR259C
YGR259C
441 nt
12.41
□□□□□ -0.42
ROX1
P25042
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
12.36
□□□□□ -0.43
ROX1
P25042
CYT2
YKL087C
675 nt
12.35
□□□□□ -0.43
ROX1
P25042
FEN2
YCR028C
1539 nt
12.34
□□□□□ -0.43
ROX1
P25042
STB1
YNL309W
1263 nt
12.34
□□□□□ -0.43
ROX1
P25042
HHO1
YPL127C
777 nt
12.33
□□□□□ -0.44
ROX1
P25042
IRC24
YIR036C
792 nt
12.31
□□□□□ -0.44
ROX1
P25042
RDN18-1
RDN18-1
1800 nt
12.3
□□□□□ -0.44
ROX1
P25042
RDN18-2
RDN18-2
1800 nt
12.3
□□□□□ -0.44
ROX1
P25042
AQY1
YPR192W
918 nt
12.3
□□□□□ -0.44
ROX1
P25042
SPC25
YER018C
666 nt
12.28
□□□□□ -0.44
ROX1
P25042
PTH1
YHR189W
573 nt
12.28
□□□□□ -0.44
ROX1
P25042
DUT1
YBR252W
444 nt
12.26
□□□□□ -0.45
ROX1
P25042
XDJ1
YLR090W
1380 nt
12.26
□□□□□ -0.45
ROX1
P25042
YIR016W
YIR016W
798 nt
12.25
□□□□□ -0.45
ROX1
P25042
YJL225C
YJL225C
5277 nt
12.25
□□□□□ -0.45
ROX1
P25042
MOT3
YMR070W
1473 nt
12.24
□□□□□ -0.45
ROX1
P25042
GPI16
YHR188C
1833 nt
12.23
□□□□□ -0.45
ROX1
P25042
VPS60
YDR486C
690 nt
12.23
□□□□□ -0.45
ROX1
P25042
STR3
YGL184C
1398 nt
12.21
□□□□□ -0.45
ROX1
P25042
YLR179C
YLR179C
606 nt
12.2
□□□□□ -0.46
ROX1
P25042
TIM23
YNR017W
669 nt
12.2
□□□□□ -0.46
ROX1
P25042
ALG3
YBL082C
1377 nt
12.19
□□□□□ -0.46
ROX1
P25042
YAT1
YAR035W
2064 nt
12.18
□□□□□ -0.46
ROX1
P25042
CMP2
YML057W
1815 nt
12.18
□□□□□ -0.46
ROX1
P25042
CCT4
YDL143W
1587 nt
12.15
□□□□□ -0.46
ROX1
P25042
YGR201C
YGR201C
678 nt
12.14
□□□□□ -0.47
ROX1
P25042
AQY2
YLL052C
450 nt
12.13
□□□□□ -0.47
ROX1
P25042
SPP1
YPL138C
1062 nt
12.11
□□□□□ -0.47
ROX1
P25042
YLR235C
YLR235C
399 nt
12.09
□□□□□ -0.47
ROX1
P25042
SWC5
YBR231C
912 nt
12.09
□□□□□ -0.47
ROX1
P25042
AHT1
YHR093W
549 nt
12.06
□□□□□ -0.48
ROX1
P25042
AVT6
YER119C
1347 nt
12.04
□□□□□ -0.48
ROX1
P25042
HSL7
YBR133C
2484 nt
12.02
□□□□□ -0.49
ROX1
P25042
GOR1
YNL274C
1053 nt
12
□□□□□ -0.49
ROX1
P25042
RTN2
YDL204W
1182 nt
11.99
□□□□□ -0.49
ROX1
P25042
GDH3
YAL062W
1374 nt
11.96
□□□□□ -0.49
ROX1
P25042
NDI1
YML120C
1542 nt
11.94
□□□□□ -0.5
ROX1
P25042
YPR064W
YPR064W
420 nt
11.91
□□□□□ -0.5
ROX1
P25042
YKL030W
YKL030W
606 nt
11.9
□□□□□ -0.5
ROX1
P25042
TAD3
YLR316C
969 nt
11.84
□□□□□ -0.51
ROX1
P25042
PLB1
YMR008C
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11.83
□□□□□ -0.52
ROX1
P25042
RPC82
YPR190C
1965 nt
11.83
□□□□□ -0.52
ROX1
P25042
SPT20
YOL148C
1815 nt
11.83
□□□□□ -0.52
ROX1
P25042
HIF1
YLL022C
1158 nt
11.82
□□□□□ -0.52
ROX1
P25042
SHM2
YLR058C
1410 nt
11.82
□□□□□ -0.52
ROX1
P25042
PRM5
YIL117C
957 nt
11.81
□□□□□ -0.52
ROX1
P25042
BDH1
YAL060W
1149 nt
11.77
□□□□□ -0.53
ROX1
P25042
INA1
YLR413W
2028 nt
11.75
□□□□□ -0.53
ROX1
P25042
ALD4
YOR374W
1560 nt
11.73
□□□□□ -0.53
ROX1
P25042
NBP35
YGL091C
987 nt
11.71
□□□□□ -0.53
ROX1
P25042
NIT1
YIL164C
600 nt
11.7
□□□□□ -0.54
ROX1
P25042
YLR415C
YLR415C
339 nt
11.7
□□□□□ -0.54
ROX1
P25042
DAT1
YML113W
747 nt
11.69
□□□□□ -0.54
ROX1
P25042
RDN25-1
RDN25-1
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11.69
□□□□□ -0.54
ROX1
P25042
RDN25-2
RDN25-2
3396 nt
11.69
□□□□□ -0.54
ROX1
P25042
ARP6
YLR085C
1317 nt
11.68
□□□□□ -0.54
ROX1
P25042
TIM17
YJL143W
477 nt
11.67
□□□□□ -0.54
ROX1
P25042
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YJR049C
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□□□□□ -0.55
ROX1
P25042
HEL2
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□□□□□ -0.55
ROX1
P25042
YCR102C
YCR102C
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11.61
□□□□□ -0.55
ROX1
P25042
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YOR007C
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11.61
□□□□□ -0.55
ROX1
P25042
RIM8
YGL045W
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11.6
□□□□□ -0.55
ROX1
P25042
YSP3
YOR003W
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□□□□□ -0.56
ROX1
P25042
MUP1
YGR055W
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11.57
□□□□□ -0.56
ROX1
P25042
tL(GAG)G
tL(GAG)G
82 nt
11.51
□□□□□ -0.57
ROX1
P25042
ZRT3
YKL175W
1512 nt
11.5
□□□□□ -0.57
ROX1
P25042
GAP1
YKR039W
1809 nt
11.49
□□□□□ -0.57
ROX1
P25042
YJL067W
YJL067W
351 nt
11.47
□□□□□ -0.57
ROX1
P25042
SHH4
YLR164W
507 nt
11.47
□□□□□ -0.57
ROX1
P25042
RTG1
YOL067C
534 nt
11.47
□□□□□ -0.57
ROX1
P25042
HOL1
YNR055C
1761 nt
11.46
□□□□□ -0.57
ROX1
P25042
YGL114W
YGL114W
2178 nt
11.45
□□□□□ -0.58
ROX1
P25042
YNL115C
YNL115C
1935 nt
11.43
□□□□□ -0.58
ROX1
P25042
PRO1
YDR300C
1287 nt
11.41
□□□□□ -0.58
ROX1
P25042
SAM35
YHR083W
990 nt
11.41
□□□□□ -0.58
ROX1
P25042
TIR3
YIL011W
810 nt
11.39
□□□□□ -0.59
ROX1
P25042
LSC2
YGR244C
1284 nt
11.37
□□□□□ -0.59
ROX1
P25042
YNL024C
YNL024C
741 nt
11.36
□□□□□ -0.59
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