Protein–RNA interactions for Protein: P21771

MRPS28, 37S ribosomal protein S28, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS28	P21771	RIM8	YGL045W	1629 nt		10.43	□□□□□ -0.74
MRPS28	P21771	YLL053C	YLL053C	459 nt		10.42	□□□□□ -0.74
MRPS28	P21771	AGP1	YCL025C	1902 nt		10.41	□□□□□ -0.74
MRPS28	P21771	YFL067W	YFL067W	528 nt		10.4	□□□□□ -0.74
MRPS28	P21771	GBP2	YCL011C	1284 nt		10.4	□□□□□ -0.74
MRPS28	P21771	YIH1	YCR059C	777 nt		10.39	□□□□□ -0.75
MRPS28	P21771	BNA2	YJR078W	1362 nt		10.39	□□□□□ -0.75
MRPS28	P21771	INA1	YLR413W	2028 nt		10.35	□□□□□ -0.75
MRPS28	P21771	RPC82	YPR190C	1965 nt		10.34	□□□□□ -0.75
MRPS28	P21771	IDH1	YNL037C	1083 nt		10.33	□□□□□ -0.76
MRPS28	P21771	YGL114W	YGL114W	2178 nt		10.3	□□□□□ -0.76
MRPS28	P21771	DDR2	YOL052C-A	186 nt		10.29	□□□□□ -0.76
MRPS28	P21771	RNQ1	YCL028W	1218 nt		10.29	□□□□□ -0.76
MRPS28	P21771	MIC12	YBR262C	321 nt		10.27	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	FTR1	YER145C	1215 nt		10.26	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	RDN18-1	RDN18-1	1800 nt		10.26	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	RDN18-2	RDN18-2	1800 nt		10.26	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	MET2	YNL277W	1461 nt		10.25	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	MAE1	YKL029C	2010 nt		10.25	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	TRM5	YHR070W	1500 nt		10.25	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	WHI5	YOR083W	888 nt		10.25	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	YDL086C-A	YDL086C-A	435 nt		10.24	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		10.24	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		10.24	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		10.24	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		10.24	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		10.24	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	HHO1	YPL127C	777 nt		10.23	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	MUP1	YGR055W	1725 nt		10.22	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	SOR2	YDL246C	1074 nt		10.22	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	SOR1	YJR159W	1074 nt		10.22	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	GAL1	YBR020W	1587 nt		10.22	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	GPI16	YHR188C	1833 nt		10.21	□□□□□ -0.77
MRPS28	P21771	STR3	YGL184C	1398 nt		10.21	□□□□□ -0.78
MRPS28	P21771	ANP1	YEL036C	1503 nt		10.2	□□□□□ -0.78
MRPS28	P21771	YCL042W	YCL042W	360 nt		10.19	□□□□□ -0.78
MRPS28	P21771	PUS2	YGL063W	1113 nt		10.18	□□□□□ -0.78
MRPS28	P21771	GDH3	YAL062W	1374 nt		10.17	□□□□□ -0.78
MRPS28	P21771	LPX1	YOR084W	1164 nt		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS28	P21771	RTN2	YDL204W	1182 nt		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS28	P21771	XDJ1	YLR090W	1380 nt		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS28	P21771	SFP1	YLR403W	2052 nt		10.1	□□□□□ -0.79
MRPS28	P21771	AQY2	YLL052C	450 nt		10.1	□□□□□ -0.79
MRPS28	P21771	HIF1	YLL022C	1158 nt		10.07	□□□□□ -0.8
MRPS28	P21771	ACO2	YJL200C	2370 nt		10.05	□□□□□ -0.8
MRPS28	P21771	HOL1	YNR055C	1761 nt		10.05	□□□□□ -0.8
MRPS28	P21771	FEN2	YCR028C	1539 nt		10.04	□□□□□ -0.8
MRPS28	P21771	YGR201C	YGR201C	678 nt		10.04	□□□□□ -0.8
MRPS28	P21771	DUT1	YBR252W	444 nt		10.04	□□□□□ -0.8
MRPS28	P21771	MXR2	YCL033C	507 nt		10.02	□□□□□ -0.81
MRPS28	P21771	YDR524C-B	YDR524C-B	201 nt		10.01	□□□□□ -0.81
MRPS28	P21771	ALD4	YOR374W	1560 nt		10.01	□□□□□ -0.81
MRPS28	P21771	YDR433W	YDR433W	441 nt		10	□□□□□ -0.81
MRPS28	P21771	DIC1	YLR348C	897 nt		10	□□□□□ -0.81
MRPS28	P21771	RPM1	RPM1	483 nt		9.99	□□□□□ -0.81
MRPS28	P21771	AQY1	YPR192W	918 nt		9.98	□□□□□ -0.81
MRPS28	P21771	YIR016W	YIR016W	798 nt		9.97	□□□□□ -0.81
MRPS28	P21771	STB1	YNL309W	1263 nt		9.97	□□□□□ -0.81
MRPS28	P21771	YMR209C	YMR209C	1374 nt		9.94	□□□□□ -0.82
MRPS28	P21771	SPC25	YER018C	666 nt		9.94	□□□□□ -0.82
MRPS28	P21771	FRD1	YEL047C	1413 nt		9.92	□□□□□ -0.82
MRPS28	P21771	PRM5	YIL117C	957 nt		9.92	□□□□□ -0.82
MRPS28	P21771	GOR1	YNL274C	1053 nt		9.92	□□□□□ -0.82
MRPS28	P21771	FMP45	YDL222C	930 nt		9.9	□□□□□ -0.82
MRPS28	P21771	UGA4	YDL210W	1716 nt		9.9	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	TPO4	YOR273C	1980 nt		9.9	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	NPP1	YCR026C	2229 nt		9.89	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	ZRT3	YKL175W	1512 nt		9.88	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	YPR011C	YPR011C	981 nt		9.88	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	HMG2	YLR450W	3138 nt		9.87	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	AVT6	YER119C	1347 nt		9.87	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	YNL024C	YNL024C	741 nt		9.87	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	PLB1	YMR008C	1995 nt		9.86	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	VPS60	YDR486C	690 nt		9.85	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	ERV46	YAL042W	1248 nt		9.85	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	MOT3	YMR070W	1473 nt		9.85	□□□□□ -0.83
MRPS28	P21771	HIS2	YFR025C	1008 nt		9.81	□□□□□ -0.84
MRPS28	P21771	ILV3	YJR016C	1758 nt		9.78	□□□□□ -0.84
MRPS28	P21771	YJL067W	YJL067W	351 nt		9.78	□□□□□ -0.84
MRPS28	P21771	YKR040C	YKR040C	504 nt		9.78	□□□□□ -0.84
MRPS28	P21771	YHL008C	YHL008C	1884 nt		9.78	□□□□□ -0.84
MRPS28	P21771	ALG3	YBL082C	1377 nt		9.77	□□□□□ -0.84
MRPS28	P21771	CCT4	YDL143W	1587 nt		9.76	□□□□□ -0.85
MRPS28	P21771	PSD1	YNL169C	1503 nt		9.74	□□□□□ -0.85
MRPS28	P21771	YOR325W	YOR325W	474 nt		9.73	□□□□□ -0.85
MRPS28	P21771	SWC5	YBR231C	912 nt		9.73	□□□□□ -0.85
MRPS28	P21771	UGP1	YKL035W	1500 nt		9.72	□□□□□ -0.85
MRPS28	P21771	COQ8	YGL119W	1506 nt		9.72	□□□□□ -0.85
MRPS28	P21771	ARP6	YLR085C	1317 nt		9.71	□□□□□ -0.86
MRPS28	P21771	CYT1	YOR065W	930 nt		9.68	□□□□□ -0.86
MRPS28	P21771	URA8	YJR103W	1737 nt		9.68	□□□□□ -0.86
MRPS28	P21771	UTR1	YJR049C	1593 nt		9.67	□□□□□ -0.86
MRPS28	P21771	YLR179C	YLR179C	606 nt		9.66	□□□□□ -0.86
MRPS28	P21771	YIL100C-A	YIL100C-A	339 nt		9.65	□□□□□ -0.86
MRPS28	P21771	SAM35	YHR083W	990 nt		9.64	□□□□□ -0.87
MRPS28	P21771	TIM23	YNR017W	669 nt		9.63	□□□□□ -0.87
MRPS28	P21771	HXK1	YFR053C	1458 nt		9.63	□□□□□ -0.87
MRPS28	P21771	ARO8	YGL202W	1503 nt		9.61	□□□□□ -0.87
MRPS28	P21771	GID7	YCL039W	2238 nt		9.6	□□□□□ -0.87
MRPS28	P21771	ALD5	YER073W	1563 nt		9.59	□□□□□ -0.87

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.5 ms