Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF1Q9BQI6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF1Q9BQI6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms