Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFCDQ8IXH7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms