Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPO2Q5TGU0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPO2Q5TGU0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms