Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN2P0C2S0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTXN2P0C2S0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms