Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5LO95447 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCA5LO95447 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms