Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHA12Q9UN75 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms