Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARS2Q9NP81 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms