Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR1

TWNK, Twinkle protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWNKQ96RR1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWNKQ96RR1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TWNKQ96RR1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms