Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CUL4AQ13619 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms