Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRJQ12913 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRJQ12913 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
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