Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCG2P13521 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCG2P13521 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCG2P13521 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCG2P13521 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCG2P13521 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG2P13521 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG2P13521 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG2P13521 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG2P13521 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG2P13521 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG2P13521 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG2P13521 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG2P13521 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG2P13521 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG2P13521 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG2P13521 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG2P13521 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCG2P13521 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCG2P13521 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCG2P13521 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCG2P13521 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCG2P13521 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCG2P13521 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCG2P13521 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG2P13521 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCG2P13521 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms