Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM9Q9NQV7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM9Q9NQV7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms