Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT2Q8N9I0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT2Q8N9I0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms