Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSL3Q8N5Y2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3Q8N5Y2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms