Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	TOM5	YPR133W-A	153 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VAR1	P02381	OM14	YBR230C	405 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VAR1	P02381	HCM1	YCR065W	1695 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	P02381	YKL023W	YKL023W	834 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	P02381	YAL044W-A	YAL044W-A	333 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	P02381	BUD28	YLR062C	378 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	P02381	MAP2	YBL091C	1266 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	P02381	SMF1	YOL122C	1728 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	P02381	ISR1	YPR106W	1332 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	P02381	AIR2	YDL175C	1035 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	TRM8	YDL201W	861 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	MDG1	YNL173C	1101 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YNL174W	YNL174W	573 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	CUE5	YOR042W	1236 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YPL077C	YPL077C	723 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	DIP2	YLR129W	2832 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	OLE1	YGL055W	1533 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	TAF7	YMR227C	1773 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YGR153W	YGR153W	654 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	RFU1	YLR073C	603 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	MID2	YLR332W	1131 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	PRE7	YBL041W	726 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	MAK3	YPR051W	531 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YPR174C	YPR174C	666 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	MTR10	YOR160W	2919 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	HIS4	YCL030C	2400 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	TAF12	YDR145W	1620 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	MTC1	YJL123C	1437 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	DAL3	YIR032C	588 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	AAD10	YJR155W	867 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	RAD27	YKL113C	1149 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	SPS18	YNL204C	903 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	GSP2	YOR185C	663 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	SWC3	YAL011W	1878 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	SKG3	YLR187W	3081 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	HRR25	YPL204W	1485 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	FRS1	YLR060W	1788 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YCR006C	YCR006C	474 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YFL064C	YFL064C	525 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	POP3	YNL282W	588 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YPR202W	YPR202W	717 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	EUG1	YDR518W	1554 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	KEX1	YGL203C	2190 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	RRP3	YHR065C	1506 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	NOP16	YER002W	696 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	GPP1	YIL053W	753 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	KTR2	YKR061W	1278 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	ATP14	YLR295C	375 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	NMD4	YLR363C	657 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	OCA1	YNL099C	717 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	CKB2	YOR039W	777 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	IKS1	YJL057C	2004 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	RDH54	YBR073W	2877 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	ARC40	YBR234C	1155 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	PUT2	YHR037W	1728 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	COT1	YOR316C	1320 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YPK9	YOR291W	4419 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	RSC3	YDR303C	2658 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	SER33	YIL074C	1410 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	OSH2	YDL019C	3852 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	RPS11A	YDR025W	471 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YDR274C	YDR274C	372 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	RCL1	YOL010W	1104 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	YPR109W	YPR109W	885 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	P02381	PRD1	YCL057W	2139 nt		3.59	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	SDA1	YGR245C	2304 nt		3.59	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	MET12	YPL023C	1974 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YNG2	YHR090C	849 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YJL218W	YJL218W	591 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YPL199C	YPL199C	723 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	BCK2	YER167W	2556 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	OPT2	YPR194C	2634 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	UPC2	YDR213W	2742 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	RVB1	YDR190C	1392 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	ENP1	YBR247C	1452 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	TOG1	YER184C	2385 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	RPS13	YDR064W	456 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	TUB2	YFL037W	1374 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	SUT1	YGL162W	900 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	GVP36	YIL041W	981 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	PRM10	YJL108C	1152 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	ISA1	YLL027W	753 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	PUT1	YLR142W	1431 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YLR283W	YLR283W	945 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YMR130W	YMR130W	909 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	NOP13	YNL175C	1212 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	GPI18	YBR004C	1302 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	BUD7	YOR299W	2241 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	RAD30	YDR419W	1899 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	ERG3	YLR056W	1098 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YLR156W	YLR156W	345 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YLR159W	YLR159W	345 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YLR161W	YLR161W	345 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YLR374C	YLR374C	390 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	P02381	ROT1	YMR200W	771 nt		3.56	□□□□□ -1.84

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