Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DFFAO00273 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DFFAO00273 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DFFAO00273 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DFFAO00273 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DFFAO00273 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DFFAO00273 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFAO00273 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFAO00273 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFAO00273 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFAO00273 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFAO00273 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFAO00273 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFAO00273 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFAO00273 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFAO00273 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DFFAO00273 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFAO00273 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFAO00273 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFAO00273 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFAO00273 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFAO00273 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFAO00273 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFAO00273 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFAO00273 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFAO00273 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
DFFAO00273 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFAO00273 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFAO00273 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFAO00273 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFAO00273 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFAO00273 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFAO00273 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFAO00273 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFAO00273 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DFFAO00273 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DFFAO00273 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DFFAO00273 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DFFAO00273 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms