Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C4Q9UKN8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF3C4Q9UKN8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms