Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPL1Q96FJ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPL1Q96FJ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.7 ms