Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCC1Q96CN9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms