Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED27Q6P2C8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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