Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB3Q12988 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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