Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 DAL7YIR031C 1665 nt6.58□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 FLO8YER109C 2400 nt6.58□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 YDL032WYDL032W 312 nt6.58□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 AAD4YDL243C 990 nt6.57□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 RPL28YGL103W 450 nt6.57□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 EFB1YAL003W 621 nt6.57□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 AIM26YKL037W 357 nt6.57□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 PER33YLR064W 822 nt6.57□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 YHR182WYHR182W 2358 nt6.57□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 RNR3YIL066C 2610 nt6.57□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 YDR445CYDR445C 408 nt6.57□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt6.56□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt6.56□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt6.56□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt6.56□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt6.56□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt6.56□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt6.56□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 YIL001WYIL001W 1542 nt6.56□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 KIN4YOR233W 2403 nt6.55□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 MSK1YNL073W 1731 nt6.55□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt6.55□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 CYC8YBR112C 2901 nt6.55□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 YHR173CYHR173C 339 nt6.54□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 MBR1YKL093W 1020 nt6.54□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 HMX1YLR205C 954 nt6.54□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 RSF1YMR030W 1131 nt6.54□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 YTA12YMR089C 2478 nt6.54□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 SEC39YLR440C 2130 nt6.54□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 AIP1YMR092C 1848 nt6.53□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 TDA1YMR291W 1761 nt6.53□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 NRD1YNL251C 1728 nt6.53□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 VPS68YOL129W 555 nt6.53□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 HIS4YCL030C 2400 nt6.53□□□□□ -1.36
TY2B-BQ12491 MGS1YNL218W 1764 nt6.52□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 HXK2YGL253W 1461 nt6.52□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 FBP1YLR377C 1047 nt6.52□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 LOH1YJL038C 660 nt6.51□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 FLD1YLR404W 858 nt6.51□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 RET3YPL010W 570 nt6.51□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 AGA1YNR044W 2178 nt6.51□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 PDR18YNR070W 4002 nt6.5□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt6.49□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 RPL18BYNL301C 561 nt6.49□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 UBX2YML013W 1755 nt6.49□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 TAF5YBR198C 2397 nt6.48□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YGL072CYGL072C 360 nt6.48□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt6.48□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 STE7YDL159W 1548 nt6.47□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 BAT2YJR148W 1131 nt6.47□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 SLX1YBR228W 915 nt6.47□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YER190C-BYER190C-B 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YFL068WYFL068W 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 NAT2YGR147C 867 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YML133W-BYML133W-B 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 RFA2YNL312W 822 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt6.46□□□□□ -1.37
TY2B-BQ12491 CYM1YDR430C 2970 nt6.46□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 MNN2YBR015C 1794 nt6.46□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 TIF34YMR146C 1044 nt6.46□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 YKL023WYKL023W 834 nt6.45□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 YGR127WYGR127W 939 nt6.44□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 GTT2YLL060C 702 nt6.44□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt6.44□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 BZZ1YHR114W 1902 nt6.43□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 RAD16YBR114W 2373 nt6.43□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 ATF1YOR377W 1578 nt6.43□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 AUA1YFL010W-A 285 nt6.43□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 DAN1YJR150C 897 nt6.43□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 YBR219CYBR219C 384 nt6.43□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 HSP30YCR021C 999 nt6.42□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 YML031C-AYML031C-A 336 nt6.42□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 MSW1YDR268W 1140 nt6.41□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 SGN1YIR001C 753 nt6.41□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 IMP1YMR150C 573 nt6.41□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 VHT1YGR065C 1782 nt6.41□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 YJR038CYJR038C 363 nt6.41□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 EOS1YNL080C 1101 nt6.41□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 VID27YNL212W 2349 nt6.4□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 VPS69YPR087W 321 nt6.4□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 SLA1YBL007C 3735 nt6.4□□□□□ -1.38
TY2B-BQ12491 YER158CYER158C 1722 nt6.4□□□□□ -1.39
TY2B-BQ12491 ERP2YAL007C 648 nt6.39□□□□□ -1.39
TY2B-BQ12491 SEC72YLR292C 582 nt6.39□□□□□ -1.39
TY2B-BQ12491 YOS9YDR057W 1629 nt6.39□□□□□ -1.39
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