Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPP08247 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPP08247 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPP08247 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPP08247 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPP08247 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPP08247 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPP08247 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPP08247 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPP08247 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPP08247 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPP08247 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPP08247 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPP08247 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPP08247 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPP08247 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPP08247 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPP08247 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPP08247 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPP08247 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPP08247 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYPP08247 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYPP08247 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYPP08247 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYPP08247 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYPP08247 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYPP08247 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYPP08247 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYPP08247 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYPP08247 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYPP08247 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYPP08247 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms