Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM4AO75164 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms