Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX15Q9NRS6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms