Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SARS2Q9NP81 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms