Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YJR026WYJR026W 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YJR028WYJR028W 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YAR010CYAR010C 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YML040WYML040W 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YML045W-AYML045W-A 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YMR051CYMR051C 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 JIP4YDR475C 2631 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 BAP3YDR046C 1815 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 ERC1YHR032W 1746 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YOS9YDR057W 1629 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YDR056CYDR056C 618 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YJL007CYJL007C 315 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 STE18YJR086W 333 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 SFH1YLR321C 1281 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YML083CYML083C 1257 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YNL203CYNL203C 612 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 MDJ2YNL328C 441 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 snR44snR44 211 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 MSS51YLR203C 1311 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 HXT8YJL214W 1710 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 SIP5YMR140W 1470 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 PRO2YOR323C 1371 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 EXG2YDR261C 1689 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 CCT5YJR064W 1689 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 CTH1YDR151C 978 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 TAF10YDR167W 621 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YGL159WYGL159W 1113 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 HRA1HRA1 564 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YKL162CYKL162C 1209 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 COS9YKL219W 1224 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YLR124WYLR124W 345 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 DPH5YLR172C 903 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YNL146WYNL146W 303 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 CMK2YOL016C 1344 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 GPH1YPR160W 2709 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-DR3Q12441 YCR015CYCR015C 954 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 HXT3YDR345C 1704 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YEL023CYEL023C 2049 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 TOS2YGR221C 1869 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 ARC15YIL062C 465 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 UIP3YAR027W 708 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 ATG34YOL083W 1239 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 TYE7YOR344C 876 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 RSC2YLR357W 2670 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 DEG1YFL001W 1329 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 ERG9YHR190W 1335 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 CLG1YGL215W 1359 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 FRE7YOL152W 1863 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 SER3YER081W 1410 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 SLC1YDL052C 912 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 BIM1YER016W 1035 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 DST1YGL043W 930 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 BUD32YGR262C 786 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 SFC1YJR095W 969 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 VPS25YJR102C 609 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YLR111WYLR111W 333 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YNL120CYNL120C 486 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 ARF3YOR094W 552 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 MSI1YBR195C 1269 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 RDS2YPL133C 1341 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 RSC58YLR033W 1509 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 MHF2YDL160C-A 243 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 SRB7YDR308C 423 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YEL010WYEL010W 351 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 CAK1YFL029C 1107 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 MRF1YGL143C 1242 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 LYS5YGL154C 819 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YGL260WYGL260W 231 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YJL114WYJL114W 681 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 CDC73YLR418C 1182 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YML053CYML053C 639 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YPL113CYPL113C 1191 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 SHC1YER096W 1539 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 BUD22YMR014W 1560 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 SPT14YPL175W 1359 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 SPO1YNL012W 1896 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 GAS5YOL030W 1455 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 CLB3YDL155W 1284 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 DOS2YDR068W 933 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 NPY1YGL067W 1155 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 TIM21YGR033C 720 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YGR079WYGR079W 1113 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 GLG2YJL137C 1143 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 CPT1YNL130C 1182 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 UTP7YER082C 1665 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 ZWF1YNL241C 1518 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 STF1YDL130W-A 261 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 UGX2YDL169C 672 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YDR203WYDR203W 318 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 COQ4YDR204W 1008 nt6.42□□□□□ -1.38
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