Protein–RNA interactions for Protein: Q09013

DMPK, Myotonin-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMPKQ09013 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMPKQ09013 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMPKQ09013 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMPKQ09013 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMPKQ09013 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMPKQ09013 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMPKQ09013 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMPKQ09013 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMPKQ09013 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMPKQ09013 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DMPKQ09013 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMPKQ09013 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms