Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP2P42575 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP2P42575 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP2P42575 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP2P42575 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP2P42575 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP2P42575 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP2P42575 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP2P42575 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP2P42575 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP2P42575 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP2P42575 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP2P42575 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP2P42575 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP2P42575 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP2P42575 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP2P42575 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP2P42575 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP2P42575 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP2P42575 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP2P42575 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP2P42575 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP2P42575 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP2P42575 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP2P42575 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP2P42575 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP2P42575 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP2P42575 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP2P42575 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP2P42575 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP2P42575 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP2P42575 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP2P42575 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP2P42575 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP2P42575 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP2P42575 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP2P42575 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP2P42575 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP2P42575 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP2P42575 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP2P42575 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP2P42575 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP2P42575 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP2P42575 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP2P42575 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP2P42575 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP2P42575 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP2P42575 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP2P42575 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP2P42575 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms