Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	APM4	YOL062C	1476 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	FUM1	YPL262W	1467 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	MNT2	YGL257C	1677 nt		4.8	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YPL245W	YPL245W	1365 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	SPR6	YER115C	576 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YMR135W-A	YMR135W-A	534 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YNL134C	YNL134C	1131 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	URE2	YNL229C	1065 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	REI1	YBR267W	1182 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	KRE6	YPR159W	2163 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	HIR2	YOR038C	2628 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	VBA1	YMR088C	1689 nt		4.79	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	RNR3	YIL066C	2610 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	ATG18	YFR021W	1503 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	PWP1	YLR196W	1731 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	SKG3	YLR187W	3081 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	BNS1	YGR230W	414 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YAR019W-A	YAR019W-A	333 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	YNL217W	YNL217W	981 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	ERG7	YHR072W	2196 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	SDA1	YGR245C	2304 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	APC1	YNL172W	5247 nt		4.78	□□□□□ -1.64
ATG12	P38316	STE20	YHL007C	2820 nt		4.77	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	SNF11	YDR073W	510 nt		4.77	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	LYS5	YGL154C	819 nt		4.77	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	DBR1	YKL149C	1218 nt		4.77	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	YNL057W	YNL057W	333 nt		4.77	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	SPS19	YNL202W	879 nt		4.77	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	YPS7	YDR349C	1791 nt		4.77	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	FLC3	YGL139W	2409 nt		4.77	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	FRS1	YLR060W	1788 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	CAF4	YKR036C	1932 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	LHP1	YDL051W	828 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	YDR396W	YDR396W	501 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	TYW3	YGL050W	822 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	MAG2	YLR427W	2013 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	RGS2	YOR107W	930 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	AAP1	YHR047C	2571 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	ALD3	YMR169C	1521 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	ALD2	YMR170C	1521 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	RVB1	YDR190C	1392 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	PRO2	YOR323C	1371 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	NUP1	YOR098C	3231 nt		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	CRT10	YOL063C	2874 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	KAR2	YJL034W	2049 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	ARN1	YHL040C	1884 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	NSI1	YDR026C	1713 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	PXR1	YGR280C	816 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	YNK1	YKL067W	462 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	PZF1	YPR186C	1290 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	ATG14	YBR128C	1035 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	YEH2	YLR020C	1617 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	RAD30	YDR419W	1899 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	RTC1	YOL138C	4026 nt		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	TAF10	YDR167W	621 nt		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	MAK3	YPR051W	531 nt		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	GMC1	YDR506C	1827 nt		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	ERG4	YGL012W	1422 nt		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	SUP35	YDR172W	2058 nt		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	ADK2	YER170W	678 nt		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	GSP2	YOR185C	663 nt		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	ECM2	YBR065C	1095 nt		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	YLH47	YPR125W	1365 nt		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	SPC97	YHR172W	2472 nt		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	VAM7	YGL212W	951 nt		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	YGP1	YNL160W	1065 nt		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	MRP21	YBL090W	534 nt		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	ODC2	YOR222W	924 nt		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	YPR071W	YPR071W	636 nt		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	P38316	SUT1	YGL162W	900 nt		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	YHR140W	YHR140W	720 nt		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	SWP1	YMR149W	861 nt		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	SAP30	YMR263W	606 nt		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	ECM23	YPL021W	564 nt		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	SUE1	YPR151C	621 nt		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	APC4	YDR118W	1959 nt		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	TUL1	YKL034W	2277 nt		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	RMR1	YGL250W	726 nt		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	ACP1	YKL192C	378 nt		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	UMP1	YBR173C	447 nt		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	NOP58	YOR310C	1536 nt		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	TUP1	YCR084C	2142 nt		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	MPS3	YJL019W	2049 nt		4.69	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	ARF2	YDL137W	546 nt		4.69	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	CIA2	YHR122W	696 nt		4.69	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	NMA1	YLR328W	1206 nt		4.69	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		4.69	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	SYP1	YCR030C	2613 nt		4.69	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	RTC5	YOR118W	1704 nt		4.69	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	PMT2	YAL023C	2280 nt		4.69	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	CTS2	YDR371W	1536 nt		4.68	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	PHO86	YJL117W	936 nt		4.68	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	CBT1	YKL208W	816 nt		4.68	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	SLZ1	YNL196C	897 nt		4.68	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	CIN5	YOR028C	888 nt		4.68	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	URA7	YBL039C	1740 nt		4.68	□□□□□ -1.66

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