Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARBP10826 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARBP10826 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARBP10826 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARBP10826 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARBP10826 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARBP10826 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RARBP10826 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RARBP10826 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RARBP10826 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARBP10826 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARBP10826 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARBP10826 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARBP10826 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RARBP10826 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARBP10826 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARBP10826 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RARBP10826 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARBP10826 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARBP10826 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARBP10826 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARBP10826 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARBP10826 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARBP10826 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RARBP10826 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARBP10826 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARBP10826 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARBP10826 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARBP10826 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARBP10826 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARBP10826 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARBP10826 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARBP10826 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARBP10826 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARBP10826 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARBP10826 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARBP10826 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARBP10826 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARBP10826 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RARBP10826 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARBP10826 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARBP10826 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARBP10826 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARBP10826 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARBP10826 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARBP10826 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARBP10826 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARBP10826 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARBP10826 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RARBP10826 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARBP10826 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARBP10826 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARBP10826 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARBP10826 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARBP10826 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARBP10826 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARBP10826 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARBP10826 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARBP10826 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RARBP10826 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RARBP10826 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARBP10826 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARBP10826 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARBP10826 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARBP10826 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARBP10826 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RARBP10826 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARBP10826 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms