Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTA3P0C7M3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTA3P0C7M3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTA3P0C7M3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms