Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	SLO1	YER180C-A	258 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YJL068C	YJL068C	900 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YKL151C	YKL151C	1014 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	ARG1	YOL058W	1263 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YOR200W	YOR200W	399 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	VID30	YGL227W	2877 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	KAP114	YGL241W	3015 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	THS1	YIL078W	2205 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	NOP7	YGR103W	1818 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	RSC6	YCR052W	1452 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	FDC1	YDR539W	1512 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	IWR1	YDL115C	1062 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YDL172C	YDL172C	480 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	PRO3	YER023W	861 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	DAM1	YGR113W	1032 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	SPL2	YHR136C	447 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	KTI12	YKL110C	942 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	POM33	YLL023C	840 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YLR118C	YLR118C	684 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	CUZ1	YNL155W	825 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	GMC1	YDR506C	1827 nt		3.85	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	GCV1	YDR019C	1203 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	COQ4	YDR204W	1008 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	GLE2	YER107C	1098 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	SKI6	YGR195W	741 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	MRPL13	YKR006C	795 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	AVO2	YMR068W	1281 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	CAR1	YPL111W	1002 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	MRI1	YPR118W	1236 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	CDC28	YBR160W	897 nt		3.84	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	FUI1	YBL042C	1920 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	TRE1	YPL176C	2352 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	DCV1	YFR012W	609 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	NIT2	YJL126W	924 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	ETT1	YOR051C	1239 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	MET8	YBR213W	825 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	EMP46	YLR080W	1335 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	THP1	YOL072W	1368 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	BRE2	YLR015W	1518 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	RRN11	YML043C	1524 nt		3.83	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YNL247W	YNL247W	2304 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	ADE4	YMR300C	1533 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	RHB1	YCR027C	630 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	ECM1	YAL059W	639 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YLR194C	YLR194C	765 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	ETR1	YBR026C	1143 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	TEA1	YOR337W	2280 nt		3.82	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	APJ1	YNL077W	1587 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YLH47	YPR125W	1365 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YJR124C	YJR124C	1347 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	ARP2	YDL029W	1176 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YEL045C	YEL045C	426 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YHL034W-A	YHL034W-A	462 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	FUN19	YAL034C	1242 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	MIM2	YLR099W-A	264 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	RPL3	YOR063W	1164 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YOR318C	YOR318C	306 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	QCR2	YPR191W	1107 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	VID22	YLR373C	2706 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	HXT7	YDR342C	1713 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	HXT6	YDR343C	1713 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	MSH1	YHR120W	2880 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	ROT2	YBR229C	2865 nt		3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	SKG6	YHR149C	2205 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	BSC5	YNR069C	1470 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	LHP1	YDL051W	828 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	THI21	YPL258C	1656 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	GSY1	YFR015C	2127 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	HSP82	YPL240C	2130 nt		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	MKS1	YNL076W	1755 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	CDC48	YDL126C	2508 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	UBX7	YBR273C	1311 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	KAR2	YJL034W	2049 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	BBC1	YJL020C	3474 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	SLC1	YDL052C	912 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	GET3	YDL100C	1065 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	MET31	YPL038W	534 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	GCR2	YNL199C	1605 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YSH1	YLR277C	2340 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	BOP2	YLR267W	1713 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	TRS23	YDR246W	660 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	SEH1	YGL100W	1050 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	FHN1	YGR131W	525 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YGR182C	YGR182C	354 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	TRX2	YGR209C	315 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	SYN8	YAL014C	768 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	RMA1	YKL132C	1293 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	YMR245W	YMR245W	621 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	P02381	PDR15	YDR406W	4590 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	NUG1	YER006W	1563 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	NDC1	YML031W	1968 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	ARC1	YGL105W	1131 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	RPB4	YJL140W	666 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	YJU2	YKL095W	837 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	TOM7	YNL070W	183 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	SFT2	YBL102W	648 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	DCS2	YOR173W	1062 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	SAM4	YPL273W	978 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	P02381	IES1	YFL013C	2079 nt		3.77	□□□□□ -1.81

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