Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3BO95985 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms