Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
N4BP3O15049 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
N4BP3O15049 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms