Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC17A6Q9P2U8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC17A6Q9P2U8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms