Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 ALG5YPL227C 1005 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 STE50YCL032W 1041 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 VHS1YDR247W 1386 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 IXR1YKL032C 1794 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 PHO8YDR481C 1701 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC28P40509 OCA5YHL029C 2040 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC28P40509 SPC42YKL042W 1092 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YKL151CYKL151C 1014 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YPL113CYPL113C 1191 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YOR1YGR281W 4434 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC28P40509 BRL1YHR036W 1416 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC28P40509 TIM54YJL054W 1437 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC28P40509 ASF2YDL197C 1578 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 PXA1YPL147W 2613 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YDR132CYDR132C 1488 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 IBA57YJR122W 1494 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 RHB1YCR027C 630 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 ERD1YDR414C 1089 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YGR011WYGR011W 327 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 NTR2YKR022C 969 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 ROT1YMR200W 771 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YOR024WYOR024W 324 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 snR3snR3 194 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 SYG1YIL047C 2709 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 ARN1YHL040C 1884 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 GPI18YBR004C 1302 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC28P40509 IFM1YOL023W 2031 nt5.21□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YKL169CYKL169C 384 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC28P40509 MDY2YOL111C 639 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC28P40509 DCC1YCL016C 1143 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC28P40509 GLT1YDL171C 6438 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC28P40509 KRS1YDR037W 1776 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YFL034WYFL034W 3222 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC28P40509 VHS2YIL135C 1311 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC28P40509 HES1YOR237W 1305 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC28P40509 ICE2YIL090W 1476 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 MBP1YDL056W 2502 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 UTR4YEL038W 684 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 PRO3YER023W 861 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 SLO1YER180C-A 258 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 MRPL25YGR076C 474 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 MAD2YJL030W 591 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 MRPL13YKR006C 795 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YLR118CYLR118C 684 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 CTR3YLR411W 726 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 RER2YBR002C 861 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 SUM1YDR310C 3189 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YAP1YML007W 1953 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YPT32YGL210W 669 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC28P40509 GTO1YGR154C 1071 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YJL107CYJL107C 1164 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC28P40509 COQ6YGR255C 1440 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC28P40509 SIP5YMR140W 1470 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC28P40509 TOS3YGL179C 1683 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 MAD3YJL013C 1548 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 ARP2YDL029W 1176 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 IRC7YFR055W 1023 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 TDH3YGR192C 999 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YHR127WYHR127W 732 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 PRP45YAL032C 1140 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 XPT1YJR133W 630 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 ISU2YOR226C 471 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 DAK1YML070W 1755 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YPL245WYPL245W 1365 nt5.17□□□□□ -1.58
SEC28P40509 ATG20YDL113C 1923 nt5.17□□□□□ -1.58
SEC28P40509 PCL6YER059W 1263 nt5.17□□□□□ -1.58
SEC28P40509 ECT1YGR007W 972 nt5.17□□□□□ -1.58
SEC28P40509 POM33YLL023C 840 nt5.17□□□□□ -1.58
SEC28P40509 HPC2YBR215W 1878 nt5.17□□□□□ -1.58
SEC28P40509 RPT2YDL007W 1314 nt5.17□□□□□ -1.58
SEC28P40509 NRD1YNL251C 1728 nt5.17□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YIL092WYIL092W 1902 nt5.17□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YHR177WYHR177W 1362 nt5.16□□□□□ -1.58
SEC28P40509 RAT1YOR048C 3021 nt5.16□□□□□ -1.58
SEC28P40509 AVT3YKL146W 2079 nt5.16□□□□□ -1.58
SEC28P40509 GDB1YPR184W 4611 nt5.16□□□□□ -1.58
SEC28P40509 FUM1YPL262W 1467 nt5.16□□□□□ -1.58
SEC28P40509 YCR006CYCR006C 474 nt5.16□□□□□ -1.58
SEC28P40509 DON1YDR273W 1098 nt5.16□□□□□ -1.58
SEC28P40509 PRS1YKL181W 1284 nt5.16□□□□□ -1.58
SEC28P40509 PUS1YPL212C 1635 nt5.15□□□□□ -1.58
SEC28P40509 LUC7YDL087C 786 nt5.15□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YER134CYER134C 537 nt5.15□□□□□ -1.59
SEC28P40509 GAL10YBR019C 2100 nt5.15□□□□□ -1.59
SEC28P40509 CTS1YLR286C 1689 nt5.15□□□□□ -1.59
SEC28P40509 WHI4YDL224C 1950 nt5.15□□□□□ -1.59
SEC28P40509 OMS1YDR316W 1416 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 RFT1YBL020W 1725 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 ASK10YGR097W 3441 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YBR138CYBR138C 1575 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 AAD6YFL056C 639 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 HPM1YIL110W 1134 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 SPG4YMR107W 348 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 NOP13YNL175C 1212 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YOR318CYOR318C 306 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YPL014WYPL014W 1146 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 VID30YGL227W 2877 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 ZUO1YGR285C 1302 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 PRM7YDL039C 2097 nt5.14□□□□□ -1.59
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