Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNAP12004 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNAP12004 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNAP12004 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNAP12004 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNAP12004 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNAP12004 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNAP12004 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNAP12004 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNAP12004 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNAP12004 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNAP12004 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNAP12004 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNAP12004 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNAP12004 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNAP12004 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNAP12004 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNAP12004 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNAP12004 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNAP12004 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNAP12004 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNAP12004 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNAP12004 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNAP12004 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNAP12004 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNAP12004 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNAP12004 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNAP12004 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNAP12004 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNAP12004 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNAP12004 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNAP12004 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCNAP12004 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCNAP12004 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCNAP12004 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNAP12004 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNAP12004 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNAP12004 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNAP12004 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNAP12004 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNAP12004 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNAP12004 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNAP12004 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNAP12004 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNAP12004 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms