Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMG1C9JSJ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMG1C9JSJ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms